EMPIAR-13504 - The cryo-EM structure of porcine serum MGAM [multiple data sets in MRCS and TIFF formats]

EMPIAR-13504

The cryo-EM structure of porcine serum MGAM [multiple data sets in MRCS and TIFF formats]

Publication:

Porcine serum maltase-glucoamylase: structure, kinetics, and inhibition

Watanabe K, Tagami T, Biwa C, Kawasaki M, Adachi N, Moriya T, Senda T, Okuyama M

Journal of enzyme inhibition and medicinal chemistry 41 (2026)

PMID: 41534875

DOI: 10.1080/14756366.2025.2612391

Related EMDB entry:

EMD-62653 EMD-62652

Deposited:

2026-03-04

Released:

2026-06-17

Last modified:

2026-06-17

Imageset size:

2.67 TB

Imageset DOI:

10.6019/EMPIAR-13504

Experimental metadata:

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Contains:

micrographs - multiframe

Image Sets

1. [EMD-62652] The cryo-EM structure of porcine serum MGAM

Category:

micrographs - multiframe

Image format:

MRCS

No. of images or tilt series:

919

Image size:

(4096, 4096)

Pixel type:

UNSIGNED BYTE

Pixel spacing:

(0.88, 0.88)

Details:

- Acceleration voltage (kV): 200
- Pixel size (A/pix): 0.88
- Spherical aberration (Cs): 2.7
- Average electron dose per image (e-/A2): 50
- Microscope: Talos Arctica G2
- Detector: Falcon3EC (4k × 4k)
- Nominal Defocus (nm): -1000 to -2500
- Number of frames per image: 50

Files:

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2. [EMD-62653] The cryo-EM structure of porcine serum MGAM bound with Acarviosyl-maltotriose

Category:

micrographs - multiframe

Image format:

TIFF

No. of images or tilt series:

6018

Image size:

(4092, 5760)

Pixel type:

UNSIGNED BYTE

Pixel spacing:

(0.83, 0.83)

Details:

- Acceleration voltage (kV): 300
- The pixel size in the image header (1 Å/px) is wrong. 0.83 Å/px is the calibrated value.
- Spherical aberration (Cs): 2.7
- Average electron dose per image (e-/A2): 49
- Microscope: Krios G3i
- Detector: Gatan K3 (6k × 4k)
- Nominal Defocus (nm): -1000 to -1800
- Number of frames per image: 49
- The first frames in all movies should be excluded from processing.

Files:

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[2026-06-17]

324件のPDBエントリーが新たに公開されました。（2026-06-17付）