EMPIAR-13495 - Cryo electron microscopy of human SCFbxo22 in complex with protacs, neosubstrates and endogeneous substrates. [multiple data sets in MRC format]

EMPIAR-13495

Cryo electron microscopy of human SCFbxo22 in complex with protacs, neosubstrates and endogeneous substrates. [multiple data sets in MRC format]

Publication:

Structural basis of NSD2 degradation via targeted recruitment of SCF-FBXO22

Robertson KC, Amann SJ, Liu T, Funk AV, Wang X, Grishkovskaya I, Mehmood A, Tabor JR, Norris-Drouin JL, Arrowsmith CH, Collins JL, Miao Y, Emanuele MJ, Haselbach D, James LI, Brown NG

Nature communications (2026)

PMID: 42026065

DOI: 10.1038/s41467-026-72235-9

Related EMDB entry:

EMD-57178 EMD-57179 EMD-57180

Deposited:

2026-03-17

Released:

2026-05-23

Last modified:

2026-05-23

Imageset size:

4.52 TB

Imageset DOI:

10.6019/EMPIAR-13495

Experimental metadata:

Download xml json

Contains:

micrographs - single frame

Image Sets

1. Motion corrected doseweighted micrographs of SCFBXO22 interacting with NSD2 via UNC10088

Category:

micrographs - single frame

Image format:

MRC

No. of images or tilt series:

48007

Image size:

(4096, 4096)

Pixel type:

32 BIT FLOAT

Pixel spacing:

(0.951, 0.951)

Details:

Motion corrected doseweighted micrographs of SCFBXO22 interacting with NSD2 via UNC10088

Files:

このエントリはPDBjからダウンロードすることはできません。

選択したファイルを無圧縮zipファイルにアーカイブ化してダウンロードします。

ダウンロードするファイル数やサイズによっては、膨大な時間がかかります。また、この機能は不安定で正常に動作しない可能性があり、ダウンロードされたファイルのチェックサムは検証されません。

rsync、aspera、globus 等の利用をおすすめします。

選択したファイルのリストをダウンロードします。

rsyncコマンド等でファイルリストを指定してダウンロードすることが可能です。

rsync -av --files-from=(path-to-filelist) rsync://empiar.pdbj.org/empiar/archive (path-to-destination)

2. Motion corrected doseweighted micrographs of SCFBXO22 interacting with NSD2 via UNC10088 and BACH1

Category:

micrographs - single frame

Image format:

MRC

No. of images or tilt series:

29805

Image size:

(4096, 4096)

Pixel type:

16 BIT FLOAT

Pixel spacing:

(0.951, 0.951)

Details:

Motion corrected doseweighted micrographs of SCFBXO22 interacting with NSD2 via UNC10088 and BACH1

Files:

このエントリはPDBjからダウンロードすることはできません。

選択したファイルを無圧縮zipファイルにアーカイブ化してダウンロードします。

rsync、aspera、globus 等の利用をおすすめします。

選択したファイルのリストをダウンロードします。

rsyncコマンド等でファイルリストを指定してダウンロードすることが可能です。

rsync -av --files-from=(path-to-filelist) rsync://empiar.pdbj.org/empiar/archive (path-to-destination)

3. Motion corrected doseweighted micrographs of SCFBXO22 interacting with NSD2 via UNC10415667

Category:

micrographs - single frame

Image format:

MRC

No. of images or tilt series:

30020

Image size:

(4096, 4096)

Pixel type:

16 BIT FLOAT

Pixel spacing:

(0.951, 0.951)

Details:

Motion corrected doseweighted micrographs of SCFBXO22 interacting with NSD2 via UNC10415667

Files:

このエントリはPDBjからダウンロードすることはできません。

選択したファイルを無圧縮zipファイルにアーカイブ化してダウンロードします。

rsync、aspera、globus 等の利用をおすすめします。

選択したファイルのリストをダウンロードします。

rsyncコマンド等でファイルリストを指定してダウンロードすることが可能です。

rsync -av --files-from=(path-to-filelist) rsync://empiar.pdbj.org/empiar/archive (path-to-destination)

Browse All Files

Quick Links

Browse EMPIAR

Sample Preparation Widget

Volume Browser

Tomo Viewer Prototype

Claim entries to your ORCiD

Talks and Tutorials

EMPIAR Quick tour

Publications

Re-use study

Statistics

EMPIAR in the news

COVID-19 Data Portal

EMDB

BioImage Archive

PDBe

EMNavigator@PDBj

PDBj

Citations

prismPYP: Power-spectrum and image domain learning for self-supervised micrograph evaluation.

He L, Bartesaghi A. (2026)

CryoSIP: unleashing protein high-resolution Cryo-EM via semantic-instance collaborative picking.

Deng Y, Wang S, Xiang M, Li Y, Zhuo L, Cao D, Fu X, Zou Q. (2026)

Unbend, correction of local beam-induced sample motion in cryo-EM images using a 3D spline model.

Kong L, Zottig X, Elferich J, Grigorieff N. (2026)

Chart builder: an interactive tool for user driven data visualization in the electron microscopy data bank.

Fonseca N, Duraisamy AK, Wang Z, Somasundharam S, Tayebinia M, de Oliveira LC, Ma M, Turner J, Patwardhan A, Kleywegt GJ, Hartley M, Morris KL. (2026)

Dual site targeting of the bacterial 70S ribosome by tetracyclines.

Devarkar SC, Lomakin IB, Wang J, Grada A, Bunick CG. (2026)

Deep-learning methods for contrast enhancement and artifact reduction in cryo-electron tomography: a systematic analysis of the state of the art and proposed improvements.

Jones HN, Deshmukh A, Pande K. (2026)

CryoVirusDB: An Annotated Dataset for AI-Based Virus Particle Identification in Cryo-EM Micrographs.

Gyawali R, Dhakal A, Wang L, Cheng J. (2026)

CryoGS: High-Quality Cryo-EM Homogeneous Reconstruction by Gaussian Splatting

Zeng B, Liu S, Cheng S, Xu G, Fan H. (2026)

Point cloud deformation modeling for particle selection following cryo-EM 2D classification.

Wang X, Mo Z, Li F, Zhang F, Wan X. (2026)

ICECREAM: high-fidelity equivariant cryo-electron tomography.

Kishore V, Debarnot V, Righetto RD, Engel BD, Dokmanić I. (2026)