EMPIAR-13386 - Membrane insertion of mitochondrial-encoded proteins regulates ribosome decoding speed [multiple data sets in MRC and MRCS formats]

EMPIAR-13386

Membrane insertion of mitochondrial-encoded proteins regulates ribosome decoding speed [multiple data sets in MRC and MRCS formats]

Publication:

Membrane insertion of mitochondrial-encoded proteins regulates ribosome decoding speed

Schöndorf T, Petrychenko V, Kotan I, Dahal D, Napieraj N, Cruz-Zaragoza LD, Wang C, Urbach O, Gall T, Dennerlein S, Kramer G, Fischer N, Rehling P

Nature structural & molecular biology 33 (2026) 853-867

PMID: 42098403

DOI: 10.1038/s41594-026-01803-w

Related EMDB entry:

Deposited:

2026-03-18

Released:

2026-05-29

Last modified:

2026-05-29

Imageset size:

3.47 TB

Imageset DOI:

10.6019/EMPIAR-13386

Experimental metadata:

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Contains:

micrographs - single frame
picked particles - single frame - processed

Image Sets

1. Motion-corrected, dose-weighted micrographs

Category:

micrographs - single frame

Image format:

MRC

No. of images or tilt series:

51805

Image size:

(4096, 4096)

Pixel type:

32 BIT FLOAT

Pixel spacing:

(1.16, 1.16)

Details:

Note: Micrographs were obtained from movie-stacks of 30-40 frames à ~1 e/A^2 by global motion-correction and dose-weighting using MotionCor2 in Relion.
- Micrographs .star-file: "micrographs.star"

Files:

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2. Shiny ribosome particles, obtained by Bayesian polishing in Relion

Category:

picked particles - single frame - processed

Image format:

MRCS

No. of images or tilt series:

533455

Image size:

(400, 400)

Pixel type:

32 BIT FLOAT

Pixel spacing:

(1.16, 1.16)

Details:

Star-files of shiny particles:
- P (EMD-55836): "particles_P.star"
- AP (EMD-55837): "particles_AP.star"
- AP* (EMD-54637): "particles_APstar.star"
- H1 (EMD-54638): "particles_H1.star"
- H2 (EMD-55838): "particles_H2.star"
- open COX1-mtRNC-OXA1L/MITRAC (EMD-54639): "particles_COX1-mtRNC-OXA1LMITRAC_open.star"
- closed COX1-mtRNC-OXA1L/MITRAC (EMD-54640): "particles_COX1-mtRNC-OXA1LMITRAC_closed.star"
Masks used for the RELION focused classifications are located in data/data/Masks

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prismPYP: Power-spectrum and image domain learning for self-supervised micrograph evaluation.

He L, Bartesaghi A. (2026)

CryoSIP: unleashing protein high-resolution Cryo-EM via semantic-instance collaborative picking.

Deng Y, Wang S, Xiang M, Li Y, Zhuo L, Cao D, Fu X, Zou Q. (2026)

Unbend, correction of local beam-induced sample motion in cryo-EM images using a 3D spline model.

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