EMPIAR-11577 - Cryo-electron tomograms of Host - S. Typhi interaction [multiple data sets in MRC format]

EMPIAR-11577

Cryo-electron tomograms of Host - S. Typhi interaction [multiple data sets in MRC format]

Publication:

The Parkinson's disease kinase LRRK2 coordinates a cell intrinsic defense pathway against the intracellular pathogen Salmonella

Lian H, Park D, Chen M, Schueder F, Lara-Tejero M, Liu J, Galan J

(---)

Related EMDB entry:

EMD-41046

Deposited:

2023-06-07

Released:

2024-04-21

Last modified:

2024-04-21

Imageset size:

381.56 GB

Imageset DOI:

10.6019/EMPIAR-11577

Experimental metadata:

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Contains:

tilt series

Image Sets

1. Unaligned tiltseries collected with Glacios at 3.827A/pix

Category:

tilt series

Image format:

MRC

No. of images or tilt series:

Image size:

(3838, 3710)

Pixel type:

UNSIGNED 32 BIT INTEGER

Pixel spacing:

(3.827, 3.827)

Details:

Tilt series collected with FEI Glacios (K2 camera) at 3.827A/pix. No energy filter. Target defocus = ~-6 micrometer.

Files:

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2. Unaligned tiltseries collected with Glacios at 3.384A/pix

Category:

tilt series

Image format:

MRC

No. of images or tilt series:

Image size:

(4092, 5760)

Pixel type:

UNSIGNED 32 BIT INTEGER

Pixel spacing:

(3.384, 3.384)

Details:

Tilt series collected with FEI Krios (K3 camera) at 3.384 A/pix. Used energy filter and VPP. Target defocus = -0.5 micrometer

Files:

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3. Unaligned tiltseries collected with Glacios at 4.556A/pix

Category:

tilt series

Image format:

MRC

No. of images or tilt series:

Image size:

(4092, 5760)

Pixel type:

UNSIGNED 32 BIT INTEGER

Pixel spacing:

(4.556, 4.556)

Details:

Tilt series collected with FEI Krios (K3 camera) at 4.556 A/pix. Used energy filter and VPP. Target defocus = -0.5 micrometer

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Citations

Structural basis for HIV-1 antagonism of host APOBEC3G via Cullin E3 ligase.

Ito F, Alvarez-Cabrera AL, Liu S, Yang H, Shiriaeva A, Zhou ZH, Chen XS. (2023)

The 2023 Nucleic Acids Research Database Issue and the online molecular biology database collection.

Rigden DJ, Fernández XM. (2023)

EMPIAR: the Electron Microscopy Public Image Archive.

Iudin A, Korir PK, Somasundharam S, Weyand S, Cattavitello C, Fonseca N, Salih O, Kleywegt GJ, Patwardhan A. (2023)

CLEMSite, a software for automated phenotypic screens using light microscopy and FIB-SEM.

Serra Lleti JM, Steyer AM, Schieber NL, Neumann B, Tischer C, Hilsenstein V, Holtstrom M, Unrau D, Kirmse R, Lucocq JM, Pepperkok R, Schwab Y. (2023)

Structure of a RecT/Redβ family recombinase in complex with a duplex intermediate of DNA annealing.

Caldwell BJ, Norris AS, Karbowski CF, Wiegand AM, Wysocki VH, Bell CE. (2022)

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