EMPIAR-11277 - Cryo Electron Microscopy of CHMP1B/IST1 Membrane-Bound Filaments with Brominated Lipid Probes [multiple data sets in MRC format]

EMPIAR-11277

Cryo Electron Microscopy of CHMP1B/IST1 Membrane-Bound Filaments with Brominated Lipid Probes [multiple data sets in MRC format]

Publication:

Brominated lipid probes expose structural asymmetries in constricted membranes

Moss FR, Lincoff J, Tucker M, Mohammed A, Grabe M, Frost A

Nature structural & molecular biology (2023)

PMID: 36624348

DOI: 10.1038/s41594-022-00898-1

Related EMDB entry:

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Deposited:

2022-05-25

Released:

2023-01-19

Last modified:

2023-01-19

Imageset size:

3.67 TB

Imageset DOI:

10.6019/EMPIAR-11277

Experimental metadata:

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Contains:

micrographs - single frame

Image Sets

1. Motion-corrected, dose-weighted micrographs of membrane-bound CHMP1B/IST1 copolymer with 0% cholesterol

Category:

micrographs - single frame

Image format:

MRC

No. of images or tilt series:

615

Image size:

(5760, 4092)

Pixel type:

32 BIT FLOAT

Pixel spacing:

(1.14, 1.14)

Details:

Micrographs were acquired at 0.07 s per frame with an 8 s total exposure. Particle coordinates with refined alignments for the 17 subunit-per-turn filament are in the RELION 3.0.8-formatted star file.

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2. Motion-corrected, dose-weighted micrographs of membrane-bound CHMP1B/IST1 copolymer with 10% cholesterol

Category:

micrographs - single frame

Image format:

MRC

No. of images or tilt series:

653

Image size:

(5760, 4092)

Pixel type:

32 BIT FLOAT

Pixel spacing:

(1.14, 1.14)

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3. Motion-corrected, dose-weighted micrographs of membrane-bound CHMP1B/IST1 copolymer with 20% cholesterol

Category:

micrographs - single frame

Image format:

MRC

No. of images or tilt series:

816

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(5760, 4092)

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4. Motion-corrected, dose-weighted micrographs of membrane-bound CHMP1B/IST1 copolymer with 30% cholesterol

Category:

micrographs - single frame

Image format:

MRC

No. of images or tilt series:

492

Image size:

(5760, 4092)

Pixel type:

32 BIT FLOAT

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5. Motion-corrected, dose-weighted micrographs of membrane-bound CHMP1B/IST1 copolymer with 40% cholesterol

Category:

micrographs - single frame

Image format:

MRC

No. of images or tilt series:

481

Image size:

(5760, 4092)

Pixel type:

32 BIT FLOAT

Pixel spacing:

(0.715, 0.715)

Details:

Micrographs were acquired at 0.1 s per frame with an 11.5 s total exposure. Particle coordinates with refined alignments for the 17 subunit-per-turn filament are in the RELION 3.0.8-formatted star file.

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6. Motion-corrected, dose-weighted micrographs of membrane-bound CHMP1B/IST1 copolymer with lipid mixture containing POPC instead of SDPC

Category:

micrographs - single frame

Image format:

MRC

No. of images or tilt series:

502

Image size:

(11520, 8184)

Pixel type:

32 BIT FLOAT

Pixel spacing:

(0.715, 0.715)

Details:

Micrographs were acquired at 0.1 s per frame with an 11.5 s total exposure. Particle coordinates with refined alignments for the 34 subunit-per-turn filament are in the RELION 3.0.8-formatted star file.

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7. Motion-corrected, dose-weighted micrographs of membrane-bound CHMP1B/IST1 copolymer without any brominated lipids

Category:

micrographs - single frame

Image format:

MRC

No. of images or tilt series:

5684

Image size:

(5760, 4092)

Pixel type:

32 BIT FLOAT

Pixel spacing:

(0.835, 0.835)

Details:

Micrographs were acquired at 0.05 s per frame with an 5.9 s total exposure. Particle coordinates with refined alignments for the 17 and 18 subunit-per-turn filaments are in the RELION 3.0.8-formatted star file.

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8. Motion-corrected, dose-weighted micrographs of membrane-bound CHMP1B/IST1 copolymer with brominated cholesterol

Category:

micrographs - single frame

Image format:

MRC

No. of images or tilt series:

1855

Image size:

(5760, 4092)

Pixel type:

32 BIT FLOAT

Pixel spacing:

(0.822, 0.822)

Details:

Micrographs were acquired at 0.05 s per frame with an 6.0 s total exposure. Particle coordinates with refined alignments for the 17 and 18 subunit-per-turn filaments are in the RELION 3.0.8-formatted star file.

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9. Motion-corrected, dose-weighted micrographs of membrane-bound CHMP1B/IST1 copolymer with iodinated cholesterol

Category:

micrographs - single frame

Image format:

MRC

No. of images or tilt series:

3186

Image size:

(5760, 4092)

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32 BIT FLOAT

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10. Motion-corrected, dose-weighted micrographs of membrane-bound CHMP1B/IST1 copolymer with brominated PIP2

Category:

micrographs - single frame

Image format:

MRC

No. of images or tilt series:

2118

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(5760, 4092)

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32 BIT FLOAT

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11. Motion-corrected, dose-weighted micrographs of membrane-bound CHMP1B/IST1 copolymer with brominated POPS

Category:

micrographs - single frame

Image format:

MRC

No. of images or tilt series:

7806

Image size:

(5760, 4092)

Pixel type:

32 BIT FLOAT

Pixel spacing:

(0.822, 0.822)

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12. Motion-corrected, dose-weighted micrographs of membrane-bound CHMP1B/IST1 copolymer with brominated SDPC

Category:

micrographs - single frame

Image format:

MRC

No. of images or tilt series:

2857

Image size:

(5760, 4096)

Pixel type:

32 BIT FLOAT

Pixel spacing:

(0.822, 0.822)

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13. Motion-corrected, dose-weighted micrographs of membrane-bound CHMP1B/IST1 copolymer with 25% brominated SDPC

Category:

micrographs - single frame

Image format:

MRC

No. of images or tilt series:

2931

Image size:

(5760, 4092)

Pixel type:

32 BIT FLOAT

Pixel spacing:

(0.822, 0.822)

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14. Motion-corrected, dose-weighted micrographs of membrane-bound CHMP1B/IST1 copolymer with 50% brominated SDPC

Category:

micrographs - single frame

Image format:

MRC

No. of images or tilt series:

3891

Image size:

(5760, 4092)

Pixel type:

32 BIT FLOAT

Pixel spacing:

(0.822, 0.822)

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15. Motion-corrected, dose-weighted micrographs of membrane-bound CHMP1B(F9A/F13A)/IST1 copolymer with brominated SDPC

Category:

micrographs - single frame

Image format:

MRC

No. of images or tilt series:

1715

Image size:

(5760, 4092)

Pixel type:

32 BIT FLOAT

Pixel spacing:

(0.822, 0.822)

Details:

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16. Motion-corrected, dose-weighted micrographs of membrane-bound CHMP1B(F9E/F13E)/IST1 copolymer with brominated SDPC

Category:

micrographs - single frame

Image format:

MRC

No. of images or tilt series:

1420

Image size:

(5760, 4092)

Pixel type:

32 BIT FLOAT

Pixel spacing:

(0.822, 0.822)

Details:

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17. Motion-corrected, dose-weighted micrographs of membrane-bound CHMP1B(F9L/F13L)/IST1 copolymer with brominated SDPC

Category:

micrographs - single frame

Image format:

MRC

No. of images or tilt series:

2188

Image size:

(5760, 4092)

Pixel type:

32 BIT FLOAT

Pixel spacing:

(0.822, 0.822)

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Gusach A, Lee Y, Khoshgrudi AN, Mukhaleva E, Ma N, Koers EJ, Chen Q, Edwards PC, Huang F, Kim J, Mancia F, Veprintsev DB, Vaidehi N, Weyand SN, Tate CG. (2024)

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