EMPIAR-11229 - Single particle cryo-EM of KdpFAB(Ser162-P, D307N)C in apo condition [multiple data sets in TIFF format]

EMPIAR-11229

Single particle cryo-EM of KdpFAB(Ser162-P, D307N)C in apo condition [multiple data sets in TIFF format]

Publication:

Inhibited KdpFABC transitions into an E1 off-cycle state

Silberberg JM, Stock C, Hielkema L, Corey RA, Rheinberger J, Wunnicke D, Dubach VRA, Stansfeld PJ, Hänelt I, Paulino C

eLife 11 (2022)

PMID: 36255052

DOI: 10.7554/elife.80988

Related EMDB entry:

EMD-14914 EMD-14916 EMD-14915

Deposited:

2022-09-16

Released:

2022-11-16

Last modified:

2022-11-16

Imageset size:

2.49 TB

Imageset DOI:

10.6019/EMPIAR-11229

Experimental metadata:

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Contains:

micrographs - multiframe

Image Sets

1. Unaligned movie frames of the KdpFAB(Ser162-P, D307N)C without nucleotide in DDM (Dataset 1)

Category:

micrographs - multiframe

Image format:

TIFF

No. of images or tilt series:

787

Image size:

(3838, 3710)

Pixel type:

UNSIGNED BYTE

Pixel spacing:

(1.012, 1.012)

Details:

Unaligned multi-frame movies with each 60 frames per movie collected at 200 kV in counting mode. Total accumulated electron exposure at specimen level corresponds to 51.5 electrons per Å^2. Movie are not gain corrected and the gain reference is provided.

Files:

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2. Unaligned movie frames of the KdpFAB(Ser162-P, D307N)C without nucleotide in DDM (Dataset 2)

Category:

micrographs - multiframe

Image format:

TIFF

No. of images or tilt series:

1370

Image size:

(3838, 3710)

Pixel type:

UNSIGNED BYTE

Pixel spacing:

(1.012, 1.012)

Details:

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3. Unaligned movie frames of the KdpFAB(Ser162-P, D307N)C without nucleotide in DDM (Dataset 3)

Category:

micrographs - multiframe

Image format:

TIFF

No. of images or tilt series:

2213

Image size:

(3838, 3710)

Pixel type:

UNSIGNED BYTE

Pixel spacing:

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4. Unaligned movie frames of the KdpFAB(Ser162-P, D307N)C without nucleotide in DDM (Dataset 4)

Category:

micrographs - multiframe

Image format:

TIFF

No. of images or tilt series:

1333

Image size:

(3838, 3710)

Pixel type:

UNSIGNED BYTE

Pixel spacing:

(1.012, 1.012)

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5. Unaligned movie frames of the KdpFAB(Ser162-P, D307N)C without nucleotide in DDM (Dataset 5)

Category:

micrographs - multiframe

Image format:

TIFF

No. of images or tilt series:

317

Image size:

(3838, 3838)

Pixel type:

UNSIGNED BYTE

Pixel spacing:

(1.012, 1.012)

Details:

Unaligned multi-frame movies with each 60 frames per movie collected at 200 kV in counting mode. Total accumulated electron exposure at specimen level corresponds to 53.3 electrons per Å^2. Movie are not gain corrected and the gain reference is provided.

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6. Unaligned movie frames of the KdpFAB(Ser162-P, D307N)C without nucleotide in DDM (Dataset 6)

Category:

micrographs - multiframe

Image format:

TIFF

No. of images or tilt series:

618

Image size:

(3838, 3710)

Pixel type:

UNSIGNED BYTE

Pixel spacing:

(1.012, 1.012)

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7. Unaligned movie frames of the KdpFAB(Ser162-P, D307N)C without nucleotide in DDM (Dataset 7)

Category:

micrographs - multiframe

Image format:

TIFF

No. of images or tilt series:

181

Image size:

(3838, 3710)

Pixel type:

UNSIGNED BYTE

Pixel spacing:

(1.012, 1.012)

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8. Unaligned movie frames of the KdpFAB(Ser162-P, D307N)C without nucleotide in DDM (Dataset 8)

Category:

micrographs - multiframe

Image format:

TIFF

No. of images or tilt series:

448

Image size:

(3838, 3710)

Pixel type:

UNSIGNED BYTE

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(1.012, 1.012)

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9. Unaligned movie frames of the KdpFAB(Ser162-P, D307N)C without nucleotide in DDM (Dataset 9)

Category:

micrographs - multiframe

Image format:

TIFF

No. of images or tilt series:

Image size:

(3838, 3710)

Pixel type:

UNSIGNED BYTE

Pixel spacing:

(1.012, 1.012)

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10. Unaligned movie frames of the KdpFAB(Ser162-P, D307N)C without nucleotide in DDM (Dataset 10)

Category:

micrographs - multiframe

Image format:

TIFF

No. of images or tilt series:

959

Image size:

(3838, 3710)

Pixel type:

UNSIGNED BYTE

Pixel spacing:

(1.012, 1.012)

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11. Unaligned movie frames of the KdpFAB(Ser162-P, D307N)C without nucleotide in DDM (Dataset 11)

Category:

micrographs - multiframe

Image format:

TIFF

No. of images or tilt series:

862

Image size:

(3838, 3710)

Pixel type:

UNSIGNED BYTE

Pixel spacing:

(1.012, 1.012)

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12. Unaligned movie frames of the KdpFAB(Ser162-P, D307N)C without nucleotide in DDM (Dataset 12)

Category:

micrographs - multiframe

Image format:

TIFF

No. of images or tilt series:

897

Image size:

(3838, 3710)

Pixel type:

UNSIGNED BYTE

Pixel spacing:

(1.012, 1.012)

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13. Unaligned movie frames of the KdpFAB(Ser162-P, D307N)C without nucleotide in DDM (Dataset 13)

Category:

micrographs - multiframe

Image format:

TIFF

No. of images or tilt series:

1248

Image size:

(3838, 3710)

Pixel type:

UNSIGNED BYTE

Pixel spacing:

(1.012, 1.012)

Details:

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14. Unaligned movie frames of the KdpFAB(Ser162-P, D307N)C without nucleotide in DDM (Dataset 14)

Category:

micrographs - multiframe

Image format:

TIFF

No. of images or tilt series:

584

Image size:

(3838, 3710)

Pixel type:

UNSIGNED BYTE

Pixel spacing:

(1.012, 1.012)

Details:

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15. Unaligned movie frames of the KdpFAB(Ser162-P, D307N)C without nucleotide in DDM (Dataset 15)

Category:

micrographs - multiframe

Image format:

TIFF

No. of images or tilt series:

954

Image size:

(3838, 3710)

Pixel type:

UNSIGNED BYTE

Pixel spacing:

(1.012, 1.012)

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Structural basis for HIV-1 antagonism of host APOBEC3G via Cullin E3 ligase.

Ito F, Alvarez-Cabrera AL, Liu S, Yang H, Shiriaeva A, Zhou ZH, Chen XS. (2023)

The 2023 Nucleic Acids Research Database Issue and the online molecular biology database collection.

Rigden DJ, Fernández XM. (2023)

EMPIAR: the Electron Microscopy Public Image Archive.

Iudin A, Korir PK, Somasundharam S, Weyand S, Cattavitello C, Fonseca N, Salih O, Kleywegt GJ, Patwardhan A. (2023)

CLEMSite, a software for automated phenotypic screens using light microscopy and FIB-SEM.

Serra Lleti JM, Steyer AM, Schieber NL, Neumann B, Tischer C, Hilsenstein V, Holtstrom M, Unrau D, Kirmse R, Lucocq JM, Pepperkok R, Schwab Y. (2023)

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