EMPIAR-10739 - Single-particle cryo-EM dataset of the complex between ALC1 and a PARylated nucleosome [multiple data sets in TIFF and MRCS formats]

EMPIAR-10739

Single-particle cryo-EM dataset of the complex between ALC1 and a PARylated nucleosome [multiple data sets in TIFF and MRCS formats]

Publication:

Structure and dynamics of the chromatin remodeler ALC1 bound to a PARylated nucleosome.

Bacic L, Gaullier G, Sabantsev A, Lehmann LC, Brackmann K, Dimakou D, Halic M, Hewitt G, Boulton SJ, Deindl S

eLife 10 (2021)

PMID: 34486521

DOI: 10.7554/elife.71420

Related EMDB entry:

EMD-13065 EMD-13070

Deposited:

2021-06-21

Released:

2023-07-25

Last modified:

2023-07-25

Imageset size:

14.87 TB

Imageset DOI:

10.6019/EMPIAR-10739

Experimental metadata:

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Contains:

micrographs - multiframe
picked particles - multiframe - processed

Image Sets

1. Unaligned movies of the complex between ALC1 and a PARylated nucleosome - batch 1

Category:

micrographs - multiframe

Image format:

TIFF

No. of images or tilt series:

14502

Image size:

(5760, 4092)

Pixel type:

UNSIGNED BYTE

Pixel spacing:

(0.84, 0.84)

Details:

40 gain-corrected frames per movie, collected on Titan Krios with K3 detector in counting mode.

Files:

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2. Unaligned movies of the complex between ALC1 and a PARylated nucleosome - batch 2

Category:

micrographs - multiframe

Image format:

TIFF

No. of images or tilt series:

19496

Image size:

(5760, 4092)

Pixel type:

UNSIGNED BYTE

Pixel spacing:

(0.84, 0.84)

Details:

40 gain-corrected frames per movie, collected on Titan Krios with K3 detector in counting mode.

Files:

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3. Extracted particles at original pixel size - large set

Category:

picked particles - multiframe - processed

Image format:

MRCS

No. of images or tilt series:

426066

Image size:

(512, 512)

Pixel type:

32 BIT FLOAT

Pixel spacing:

(0.84, 0.84)

Details:

Large set of particles, homogeneous in composition/stoichiometry but highly heterogeneous in conformation, as assessed by RELION Refine3D.

Files:

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4. Extracted particles at original pixel size - smaller subset

Category:

picked particles - multiframe - processed

Image format:

MRCS

No. of images or tilt series:

43698

Image size:

(512, 512)

Pixel type:

32 BIT FLOAT

Pixel spacing:

(0.84, 0.84)

Details:

Smaller subset of particles, homogeneous in composition/stoichiometry but heterogeneous in conformation, as assessed by RELION Refine3D. Conformational heterogeneity was tractable using cryoSPARC 3DVA and cryoDRGN.

Files:

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[2026-06-10]

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