EMPIAR-10171 - CryoET of apoferritin with 0.5 mM TCEP single particle with spot-to-plunge time of 170ms [multiple data sets in MRC and Other formats]

EMPIAR-10171

CryoET of apoferritin with 0.5 mM TCEP single particle with spot-to-plunge time of 170ms [multiple data sets in MRC and Other formats]

Publication:

Reducing effects of particle adsorption to the air-water interface in cryoEM

Noble AJ, Wei H, Dandey VP, Zhang Z, Potter CS, Carragher B

BioRxiv (---)

DOI: 10.1101/288340

Related EMDB entry:

EMD-7627

Deposited:

2018-04-03

Released:

2018-04-05

Last modified:

2018-04-05

Imageset size:

31.62 GB

Imageset DOI:

10.6019/EMPIAR-10171

Experimental metadata:

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Contains:

tilt series
Other

Image Sets

1. Tilt-series image stacks

Category:

tilt series

Image format:

MRC

No. of images or tilt series:

Image size:

(3712, 4984)

Pixel type:

SIGNED 16 BIT INTEGER

Pixel spacing:

(2.34, 2.34)

Details:

Not frame-aligned.
.mdoc files included.

Files:

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2. Manual particle picking in Dynamo

Category:

Other

Image format:

Other

No. of images or tilt series:

Image size:

(None, None)

Pixel type:

32 BIT FLOAT

Pixel spacing:

(None, None)

Details:

Binned by 4 manual particle picking of the series0001 tomogram using Dynamo. Manual picking was performed to accurately distinguish between particles adsorbed to the air-water interfaces, non-adsorbed particles, and particles over or adsorbed to carbon.

Files:

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3. Appion-Protomo tilt-series alignments

Category:

tilt series

Image format:

MRC

No. of images or tilt series:

Image size:

(3712, 4984)

Pixel type:

32 BIT FLOAT

Pixel spacing:

(2.34, 2.34)

Details:

Includes a full tilt-series alignment run for each tilt-series. To view properly, navigate to the protomo_alignments folder in Appion-Protomo.

Files:

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[2026-06-10]

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