EMPIAR-13331 - Cryo electron tomography of BG505 HIV-1 Env in a virus-like particle [multiple data sets in EER format]

EMPIAR-13331

Cryo electron tomography of BG505 HIV-1 Env in a virus-like particle [multiple data sets in EER format]

Publication:

N-Glycans Modulate HIV-1 Env Conformational Plasticity

Shehata M, Casalino L, Duquette M, Chen S, Flaherty A, Villa E, Amaro RE

bioRxiv (2025)

DOI: 10.1101/2025.03.26.645577

Related EMDB entry:

EMD-75641

Deposited:

2025-11-06

Released:

2026-04-09

Last modified:

2026-04-09

Imageset size:

962.95 GB

Imageset DOI:

10.6019/EMPIAR-13331

Experimental metadata:

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Contains:

micrographs - multiframe

Image Sets

1. Raw cryoET data from collection on 7/18/2025

Category:

micrographs - multiframe

Image format:

EER

No. of images or tilt series:

4012

Image size:

(4096, 4096)

Pixel type:

UNSIGNED 16 BIT INTEGER

Pixel spacing:

(1.561, 1.561)

Details:

There are 224 EER frames per image, and each tilt series is comprised of up to 37 tilts. Some of them have fewer tilts because the stage has a maximum tilt angle and some of the targets had a larger estimated pre-tilt while setting up paceTOMO. Associated metadata from SerialEM is in the mdocs folder.

Files:

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2. Raw cryoET data from collection on 7/19/2025

Category:

micrographs - multiframe

Image format:

EER

No. of images or tilt series:

5884

Image size:

(4096, 4096)

Pixel type:

UNSIGNED 16 BIT INTEGER

Pixel spacing:

(1.561, 1.561)

Details:

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Citations

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He L, Bartesaghi A. (2026)

CryoSIP: unleashing protein high-resolution Cryo-EM via semantic-instance collaborative picking.

Deng Y, Wang S, Xiang M, Li Y, Zhuo L, Cao D, Fu X, Zou Q. (2026)

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