EMPIAR-13318 - Cryo-EM of Pseudomonas phage LUZ19 [multiple data sets in MRC, TIFF and EER formats]

EMPIAR-13318

Cryo-EM of Pseudomonas phage LUZ19 [multiple data sets in MRC, TIFF and EER formats]

Publication:

Structure and host attachment of Pseudomonas phage LUZ19

Štefánik Sobotková A, Cieniková Z, Mironova Y, Plevka P, Hlavenková Z

(---)

Related EMDB entry:

EMD-54828 EMD-56773 EMD-54818 EMD-54599 EMD-54427 EMD-54676 EMD-55352

Deposited:

2026-02-11

Released:

2026-11-09

Last modified:

2026-11-09

Imageset size:

1.81 TB

Imageset DOI:

10.6019/EMPIAR-13318

Experimental metadata:

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Contains:

micrographs - multiframe

Image Sets

1. Phage LUZ19 SPA dataset 1

Category:

micrographs - multiframe

Image format:

MRC

No. of images or tilt series:

14878

Image size:

(4096, 4096)

Pixel type:

32 BIT FLOAT

Pixel spacing:

(1.07, 1.07)

Details:

Motion corrected micrographs of phage LUZ19. This dataset was merged with the SPA dataset 2 stored in the folder: data/SPA_LUZ19_200205 and used for single particle analysis of phage LUZ19 native particle. Particle and sub-particle positions are stored as a star files in the listed directory.

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2. Phage LUZ19 SPA dataset 2

Category:

micrographs - multiframe

Image format:

MRC

No. of images or tilt series:

10702

Image size:

(4096, 4096)

Pixel type:

32 BIT FLOAT

Pixel spacing:

(1.063, 1.063)

Details:

Motion corrected micrographs of phage LUZ19. This dataset was merged with the SPA dataset 1 stored in the folder data/SPA_LUZ19_191207 and used for single-particle analysis of the native phage LUZ19 particle. The apix of this dataset was curated to 1.07A. Particle and sub-particle positions are stored as a star files in the listed directory.

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3. Phage LUZ19 infection on PAO1 tomography dataset

Category:

micrographs - multiframe

Image format:

TIFF

No. of images or tilt series:

3731

Image size:

(4096, 5760)

Pixel type:

UNSIGNED BYTE

Pixel spacing:

(1.65, 1.65)

Details:

Unprocessed micrographs of tilt series capturing the phage LUZ19 early infection of PAO1 cells. The mdocs corresponding to tomograms collected from this dataset are located in the folder: data/tomo_LUZ19_PAO1_tomo_mdoc. The Gain acquired during the data collection in the folder: data/tomo_LUZ19_PAO1_gain. Due to a badly collected gain, it was trimmed. The movie of the reconstructed and segmented tomogram number 84 from this dataset is in the folder: data/LUZ19_T4P_mov.

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4. Phage LUZ19 ejectosome tomography

Category:

micrographs - multiframe

Image format:

EER

No. of images or tilt series:

3186

Image size:

(4096, 4096)

Pixel type:

UNSIGNED BYTE

Pixel spacing:

(1.55, 1.55)

Details:

Files:

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