EMPIAR-13295 - Cryo-EM of Staphylococcus phage 812 particles after genome release treatment [multiple data sets in TIFF format]

EMPIAR-13295

Cryo-EM of Staphylococcus phage 812 particles after genome release treatment [multiple data sets in TIFF format]

Publication:

Genome anchoring, retention, and release by neck proteins of Staphylococcus phage 812

Cieniková Z, Nováček J, Šiborová M, Popelářová B, Füzik T, Botka T, Benešík M, Bárdy P, Pantůček R, Plevka P

Communications biology 9 (2026)

PMID: 41507424

DOI: 10.1038/s42003-025-09477-8

Related EMDB entry:

EMD-18395 EMD-18372 EMD-18369 EMD-18385 EMD-18213 EMD-18065 EMD-18048

Deposited:

2026-02-10

Released:

2026-03-04

Last modified:

2026-03-04

Imageset size:

1.74 TB

Imageset DOI:

10.6019/EMPIAR-13295

Experimental metadata:

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Contains:

micrographs - multiframe

Image Sets

1. Unaligned multi-frame micrographs of phage 812 after genome ejection, batch 1

Category:

micrographs - multiframe

Image format:

TIFF

No. of images or tilt series:

2001

Image size:

(3838, 3710)

Pixel type:

UNSIGNED BYTE

Pixel spacing:

(1.057, 1.057)

Details:

Each multi-frame micrograph has a corresponding metadata file [name].mdoc. Particle positions and orientations (provided as Relion .star files for each associated EMDB entry) were determined on images after alignment and dose-weighting of the multi-frame micrographs. Gain reference file CountRef_mic_Jun22_14.27.36.dm4 and detector defect file k2Defects.txt are provided in data/.

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2. Unaligned multi-frame micrographs of phage 812 after genome ejection, batch 2

Category:

micrographs - multiframe

Image format:

TIFF

No. of images or tilt series:

2104

Image size:

(3838, 3710)

Pixel type:

UNSIGNED BYTE

Pixel spacing:

(1.057, 1.057)

Details:

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3. Unaligned multi-frame micrographs of phage 812 after genome ejection, batch 3

Category:

micrographs - multiframe

Image format:

TIFF

No. of images or tilt series:

2044

Image size:

(3838, 3710)

Pixel type:

UNSIGNED BYTE

Pixel spacing:

(1.057, 1.057)

Details:

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4. Unaligned multi-frame micrographs of phage 812 after genome ejection, batch 4

Category:

micrographs - multiframe

Image format:

TIFF

No. of images or tilt series:

794

Image size:

(3838, 3710)

Pixel type:

UNSIGNED BYTE

Pixel spacing:

(1.057, 1.057)

Details:

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5. Unaligned multi-frame micrographs of phage 812 after genome ejection, batch 5

Category:

micrographs - multiframe

Image format:

TIFF

No. of images or tilt series:

2109

Image size:

(3838, 3710)

Pixel type:

UNSIGNED BYTE

Pixel spacing:

(1.057, 1.057)

Details:

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6. Unaligned multi-frame micrographs of phage 812 after genome ejection, batch 6

Category:

micrographs - multiframe

Image format:

TIFF

No. of images or tilt series:

2153

Image size:

(3838, 3710)

Pixel type:

UNSIGNED BYTE

Pixel spacing:

(1.057, 1.057)

Details:

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7. Unaligned multi-frame micrographs of phage 812 after genome ejection, batch 7

Category:

micrographs - multiframe

Image format:

TIFF

No. of images or tilt series:

792

Image size:

(3838, 3710)

Pixel type:

UNSIGNED BYTE

Pixel spacing:

(1.057, 1.057)

Details:

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8. Unaligned multi-frame micrographs of phage 812 after genome ejection, batch 8

Category:

micrographs - multiframe

Image format:

TIFF

No. of images or tilt series:

2115

Image size:

(3838, 3710)

Pixel type:

UNSIGNED BYTE

Pixel spacing:

(1.057, 1.057)

Details:

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9. Unaligned multi-frame micrographs of phage 812 after genome ejection, batch 9

Category:

micrographs - multiframe

Image format:

TIFF

No. of images or tilt series:

1259

Image size:

(3838, 3710)

Pixel type:

UNSIGNED BYTE

Pixel spacing:

(1.057, 1.057)

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prismPYP: Power-spectrum and image domain learning for self-supervised micrograph evaluation.

He L, Bartesaghi A. (2026)

CryoSIP: unleashing protein high-resolution Cryo-EM via semantic-instance collaborative picking.

Deng Y, Wang S, Xiang M, Li Y, Zhuo L, Cao D, Fu X, Zou Q. (2026)

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Wang X, Mo Z, Li F, Zhang F, Wan X. (2026)

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Kishore V, Debarnot V, Righetto RD, Engel BD, Dokmanić I. (2026)