EMPIAR-12928 - Cas1-2/3 integration complex, 34 bp foreign DNA with PAM, CRISPR leader-repeat-spacer DNA fragment [multiple data sets in TIFF format]

EMPIAR-12928

Cas1-2/3 integration complex, 34 bp foreign DNA with PAM, CRISPR leader-repeat-spacer DNA fragment [multiple data sets in TIFF format]

Publication:

Structures reveal how the Cas1-2/3 integrase captures, delivers, and integrates foreign DNA into CRISPR loci

Henriques WS, Bowman J, Hall LN, Gauvin CC, Wei H, Kuang H, Zimanyi CM, Eng ET, Santiago-Frangos A, Wiedenheft B

bioRxiv (2025)

PMID: 40661357

DOI: 10.1101/2025.06.10.658980

Related EMDB entry:

EMD-71101 EMD-71112

Deposited:

2025-08-11

Released:

2025-11-04

Last modified:

2025-11-04

Imageset size:

9.13 TB

Imageset DOI:

10.6019/EMPIAR-12928

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Contains:

micrographs - multiframe

Image Sets

1. 1/5 Unaligned multi-frame micrographs of the Cas1-2/3 heterohexameric complex bound to a 34 bp fragment of dsDNA with a PAM and to a dsDNA fragment containing the CRISPR leader, repeat, and spacer

Category:

micrographs - multiframe

Image format:

TIFF

No. of images or tilt series:

1756

Image size:

(5760, 4092)

Pixel type:

SIGNED BYTE

Pixel spacing:

(1.152, 1.152)

Details:

Movies were acquired using a Gatan K3 direct electron detector, operated in electron counting mode targeting a total electron exposure of 65.67 e-/Å2 over 50 frames (5.992 second exposure, 0.12 second frame time). The SerialEM data collection software was used to collect micrographs at 36,000x nominal magnification (1.152 Å/pixel at the specimen level) over a defocus range of -0.5 µm to -2.0 µm. Movies were gain-corrected on the microscope server so no gain reference is provided.

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2. 2/5 Unaligned multi-frame micrographs of the Cas1-2/3 heterohexameric complex bound to a 34 bp fragment of dsDNA with a PAM and to a dsDNA fragment containing the CRISPR leader, repeat, and spacer

Category:

micrographs - multiframe

Image format:

TIFF

No. of images or tilt series:

1841

Image size:

(5760, 4092)

Pixel type:

SIGNED BYTE

Pixel spacing:

(1.152, 1.152)

Details:

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3. 3/5 Unaligned multi-frame micrographs of the Cas1-2/3 heterohexameric complex bound to a 34 bp fragment of dsDNA with a PAM and to a dsDNA fragment containing the CRISPR leader, repeat, and spacer

Category:

micrographs - multiframe

Image format:

TIFF

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3759

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(5760, 4092)

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SIGNED BYTE

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4. 4/5 Unaligned multi-frame micrographs of the Cas1-2/3 heterohexameric complex bound to a 34 bp fragment of dsDNA with a PAM and to a dsDNA fragment containing the CRISPR leader, repeat, and spacer

Category:

micrographs - multiframe

Image format:

TIFF

No. of images or tilt series:

2055

Image size:

(5760, 4092)

Pixel type:

SIGNED BYTE

Pixel spacing:

(1.152, 1.152)

Details:

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5. 5/5 Unaligned multi-frame micrographs of the Cas1-2/3 heterohexameric complex bound to a 34 bp fragment of dsDNA with a PAM and to a dsDNA fragment containing the CRISPR leader, repeat, and spacer

Category:

micrographs - multiframe

Image format:

TIFF

No. of images or tilt series:

995

Image size:

(11520, 8184)

Pixel type:

SIGNED BYTE

Pixel spacing:

(0.576, 0.576)

Details:

Movies were acquired using a Gatan K3 direct electron detector, operated in electron counting mode targeting a total electron exposure of 65.67 e-/Å2 over 50 frames (5.992 second exposure, 0.12 second frame time). The SerialEM data collection software was used to collect micrographs at 36,000x nominal magnification (1.152 Å/pixel at the specimen level, collected in super-resolution mode with a physical pixel size of 0.576 A/pixel.) over a defocus range of -0.5 µm to -2.0 µm. Movies were gain-corrected on the microscope server so no gain reference is provided.

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