EMPIAR-12875 - Electron Cryomicroscopy of alpha-Latrotoxin [multiple data sets in MRC, EER and SPIDER formats]

EMPIAR-12875

Electron Cryomicroscopy of alpha-Latrotoxin [multiple data sets in MRC, EER and SPIDER formats]

Publication:

Molecular mechanism of α-latrotoxin action

Klink B, Alavizargar A, Kalyankumar KS, Chen M, Heuer A, Gatsogiannis C

bioRxiv (2024)

DOI: 10.1101/2024.03.06.583760

Related EMDB entry:

EMD-51494 EMD-51495 EMD-51490 EMD-51475 EMD-51484 EMD-51488 EMD-51485 EMD-51479 EMD-51474 EMD-51476

Deposited:

2024-09-26

Released:

2025-10-29

Last modified:

2025-10-29

Imageset size:

27.84 TB

Imageset DOI:

10.6019/EMPIAR-12875

Experimental metadata:

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Contains:

micrographs - single frame
micrographs - multiframe
picked particles - single frame - unprocessed

Image Sets

1. Motion corrected micrographs of alpha-LTX

Category:

micrographs - single frame

Image format:

MRC

No. of images or tilt series:

87895

Image size:

(4096, 4096)

Pixel type:

16 BIT FLOAT

Pixel spacing:

(0.58, 0.58)

Details:

Motion corrected micrographs of alpha-LTX. The micrographs are the motion corrected average of 49-51 movie fractions, which were themself created from 918-1225 EER movie frames. The accumulated electron dose was ~50 electrons per square Angstroem. The coordinates for the aLTX Pore and Prepore state are located in the respective folders data/aLTX_Coordinates_Pore_4_EMPIAR and data/aLTX_Coordinates_Prepore_4_EMPIAR, Picked particle positions are in corresponding .box text files (with X and Y coordinates in 1st and second column respectively). The movies in Falcon 4i Electron Event Representation (EER) are in the folder data/aLTX_EERs_4_EMPIAR.

Files:

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2. Unaligned Falcon 4i movies in Electron Event Representation (EER)

Category:

micrographs - multiframe

Image format:

EER

No. of images or tilt series:

87915

Image size:

(16384, 16384)

Pixel type:

BIT

Pixel spacing:

(0.145, 0.145)

Details:

Movies in Falcon 4i Electron Event Representation (EER).

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3. Particle Coordinates of the aLTX prepore state in Sphire .box format

Category:

picked particles - single frame - unprocessed

Image format:

SPIDER

No. of images or tilt series:

442105

Image size:

(4096, 4096)

Pixel type:

UNSIGNED BYTE

Pixel spacing:

(0.58, 0.58)

Details:

Particle positions of aLTX Prepore in corresponding .box text files (with X and Y coordinates in 1st and second column respectively, as used by the software package SPHIRE).

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4. Particle Coordinates of the aLTX Pore state in Sphire .box format

Category:

picked particles - single frame - unprocessed

Image format:

SPIDER

No. of images or tilt series:

70971

Image size:

(4096, 4096)

Pixel type:

UNSIGNED BYTE

Pixel spacing:

(0.58, 0.58)

Details:

Particle positions of aLTX Pore in corresponding .box text files (with X and Y coordinates in 1st and second column respectively, as used by the software package SPHIRE).

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