EMPIAR-12857 - Cryoelectron microscopy image of wild-type Escherichia coli cell [1 micrographs in MRC format]

EMPIAR-12857

Cryoelectron microscopy image of wild-type Escherichia coli cell [1 micrographs in MRC format]

Publication:

Bacterial cell widening alters periplasmic size and activates envelope stress responses

Zietek M, Miguel A, Shi H, Khusainov I, Asmar A, Ram S, Wartel M, Sueki A, Schorb M, Goulian M, Collet J-F, Beck M, Huang KC, Typas A

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Deposited:

2025-06-27

Released:

2025-07-31

Last modified:

2025-07-31

Imageset size:

657.56 MB

Imageset DOI:

10.6019/EMPIAR-12857

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Contains:

micrographs - single frame

Image Sets

1. Cryoelectron microscopy image of wild-type Escherichia coli cell

Category:

micrographs - single frame

Image format:

MRC

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He L, Bartesaghi A. (2026)

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