EMPIAR-12707 - Single particle cryo-EM micrographs and particles of OLE RNA dimer [multiple data sets in MRC format]

EMPIAR-12707

Single particle cryo-EM micrographs and particles of OLE RNA dimer [multiple data sets in MRC format]

Publication:

Naturally ornate RNA-only complexes revealed by cryo-EM

Kretsch RC, Wu Y, Shabalina SA, Lee H, Nye G, Koonin EV, Gao A, Chiu W, Das R

bioRxiv (2024)

DOI: 10.1101/2024.12.08.627333

Related EMDB entry:

EMD-48163

Deposited:

2025-04-15

Released:

2025-06-27

Last modified:

2025-06-27

Imageset size:

437.71 GB

Imageset DOI:

10.6019/EMPIAR-12707

Experimental metadata:

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Contains:

micrographs - single frame
picked particles - single frame - processed

Image Sets

1. Aligned and dose-weight averaged micrographs of OLE RNA dimer.

Category:

micrographs - single frame

Image format:

MRC

No. of images or tilt series:

6324

Image size:

(4096, 4096)

Pixel type:

32 BIT FLOAT

Pixel spacing:

(0.954, 0.954)

Details:

The micrographs are the dose-weighted average by patch motion correction in cryosparc.

Files:

選択したファイルを無圧縮zipファイルにアーカイブ化してダウンロードします。

ダウンロードするファイル数やサイズによっては、膨大な時間がかかります。また、この機能は不安定で正常に動作しない可能性があり、ダウンロードされたファイルのチェックサムは検証されません。

rsync、aspera、globus 等の利用をおすすめします。

選択したファイルのリストをダウンロードします。

rsyncコマンド等でファイルリストを指定してダウンロードすることが可能です。

rsync -av --files-from=(path-to-filelist) rsync://empiar.pdbj.org/empiar/archive (path-to-destination)

2. Particle images of OLE RNA dimer.

Category:

picked particles - single frame - processed

Image format:

MRC

No. of images or tilt series:

87716

Image size:

(360, 360)

Pixel type:

32 BIT FLOAT

Pixel spacing:

(0.954, 0.954)

Details:

Particle parameters are from the final C2 reconstruction of OLE. Local motion trajectories are provided in data/ole_particles/J767.

Files:

選択したファイルを無圧縮zipファイルにアーカイブ化してダウンロードします。

rsync、aspera、globus 等の利用をおすすめします。

選択したファイルのリストをダウンロードします。

rsyncコマンド等でファイルリストを指定してダウンロードすることが可能です。

rsync -av --files-from=(path-to-filelist) rsync://empiar.pdbj.org/empiar/archive (path-to-destination)

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