EMPIAR-12506 - Single-particle cryoEM data of copper-loaded ABC transporter MsbA [5530 multi-frame micrographs composed of 40 frames each in TIFF format]

EMPIAR-12506

Single-particle cryoEM data of copper-loaded ABC transporter MsbA [5530 multi-frame micrographs composed of 40 frames each in TIFF format]

Publication:

Structural basis for lipid and copper regulation of the ABC transporter MsbA

Lyu J, Liu C, Zhang T, Schrecke S, Elam NP, Packianathan C, Hochberg GKA, Russell D, Zhao M, Laganowsky A

Nature communications 13 (2022)

PMID: 36435815

DOI: 10.1038/s41467-022-34905-2

Related EMDB entry:

EMD-27545

Deposited:

2024-12-30

Released:

2025-07-25

Last modified:

2025-07-25

Imageset size:

2.53 TB

Imageset DOI:

10.6019/EMPIAR-12506

Experimental metadata:

Download xml json

Contains:

micrographs - multiframe

Image Sets

1. Unaligned multi-frame raw data

Category:

micrographs - multiframe

Image format:

TIFF

No. of images or tilt series:

5530

Image size:

(11520, 8184)

Pixel type:

UNSIGNED BYTE

Pixel spacing:

(0.5325, 0.5325)

Details:

Total dose: 50 electrons per square angstrom.

Files:

このエントリはPDBjからダウンロードすることはできません。

選択したファイルを無圧縮zipファイルにアーカイブ化してダウンロードします。

ダウンロードするファイル数やサイズによっては、膨大な時間がかかります。また、この機能は不安定で正常に動作しない可能性があり、ダウンロードされたファイルのチェックサムは検証されません。

rsync、aspera、globus 等の利用をおすすめします。

選択したファイルのリストをダウンロードします。

rsyncコマンド等でファイルリストを指定してダウンロードすることが可能です。

rsync -av --files-from=(path-to-filelist) rsync://empiar.pdbj.org/empiar/archive (path-to-destination)

Browse All Files

Quick Links

Browse EMPIAR

Sample Preparation Widget

Volume Browser

Tomo Viewer Prototype

Claim entries to your ORCiD

Talks and Tutorials

EMPIAR Quick tour

Publications

Re-use study

Statistics

EMPIAR in the news

COVID-19 Data Portal

EMDB

BioImage Archive

PDBe

EMNavigator@PDBj

PDBj

Citations

CryoSIP: unleashing protein high-resolution Cryo-EM via semantic-instance collaborative picking.

Deng Y, Wang S, Xiang M, Li Y, Zhuo L, Cao D, Fu X, Zou Q. (2026)

prismPYP: Power-spectrum and image domain learning for self-supervised micrograph evaluation.

He L, Bartesaghi A. (2026)

Unbend, correction of local beam-induced sample motion in cryo-EM images using a 3D spline model.

Kong L, Zottig X, Elferich J, Grigorieff N. (2026)

Chart builder: an interactive tool for user driven data visualization in the electron microscopy data bank.

Fonseca N, Duraisamy AK, Wang Z, Somasundharam S, Tayebinia M, de Oliveira LC, Ma M, Turner J, Patwardhan A, Kleywegt GJ, Hartley M, Morris KL. (2026)

CryoVirusDB: An Annotated Dataset for AI-Based Virus Particle Identification in Cryo-EM Micrographs.

Gyawali R, Dhakal A, Wang L, Cheng J. (2026)

Dual site targeting of the bacterial 70S ribosome by tetracyclines.

Devarkar SC, Lomakin IB, Wang J, Grada A, Bunick CG. (2026)

Deep-learning methods for contrast enhancement and artifact reduction in cryo-electron tomography: a systematic analysis of the state of the art and proposed improvements.

Jones HN, Deshmukh A, Pande K. (2026)

CryoGS: High-Quality Cryo-EM Homogeneous Reconstruction by Gaussian Splatting

Zeng B, Liu S, Cheng S, Xu G, Fan H. (2026)

Point cloud deformation modeling for particle selection following cryo-EM 2D classification.

Wang X, Mo Z, Li F, Zhang F, Wan X. (2026)

ICECREAM: high-fidelity equivariant cryo-electron tomography.

Kishore V, Debarnot V, Righetto RD, Engel BD, Dokmanić I. (2026)

See all citations

Protein Data Bank Japan News

[2026-06-03]

363件のPDBエントリーが新たに公開されました。（2026-06-03付）

[2026-05-19]

[wwPDB] PDB Versioned および NextGen アーカイブにおける rsync利用の変更

[2026-05-14]

第26回日本蛋白質科学会年会にてランチョンセミナーを開催します

[2026-04-30]

[wwPDB] 2027年7月21日以降に公開されるエントリーについてPDB DOIの構文が新しくなります

[2026-04-26]

[wwPDB] 2027年7月21日に、PDBベータアーカイブが現行アーカイブに置き換わります

[2026-04-21]

[wwPDB] PDBとEMDBエントリーの公開済みの検証レポートを更新しました

[2026-03-30]

PDBj Newsletter Vol.26公開のお知らせ

[2026-03-13]

[wwPDB] CASP17（2026）ターゲットを募集しています

[2026-03-07]

[wwPDB] PDBエントリーが25万件を達成しました

[2026-02-11]

[wwPDB] 新しいPDBベータアーカイブをテスト用にご利用ください

See all news