EMPIAR-11501 - Cryo-EM structure of the chain-elongating E3 ubiquitin ligase UBR5 [multiple data sets in MRC format]

EMPIAR-11501

Cryo-EM structure of the chain-elongating E3 ubiquitin ligase UBR5 [multiple data sets in MRC format]

Publication:

Cryo-EM structure of the chain-elongating E3 ligase UBR5

Hodáková Z, Grishkovskaya I, Brunner HL, Bolhuis DL, Belačić K, Schleiffer A, Kotisch H, Brown NG, Haselbach D

bioRxiv (2022)

DOI: 10.1101/2022.11.03.515015

Related EMDB entry:

EMD-16087

Deposited:

2023-03-28

Released:

2024-02-13

Last modified:

2024-02-13

Imageset size:

2.07 TB

Imageset DOI:

10.6019/EMPIAR-11501

Experimental metadata:

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Contains:

micrographs - single frame

Image Sets

1. Motion-corrected and dose-weighted micrographs of UBR5-CHAPSO dataset

Category:

micrographs - single frame

Image format:

MRC

No. of images or tilt series:

8283

Image size:

(4096, 4096)

Pixel type:

32 BIT FLOAT

Pixel spacing:

(0.7445, 0.7445)

Details:

CHAPSO dataset

Files:

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2. Motion-corrected and dose-weighted micrographs of UBR5-fOM dataset

Category:

micrographs - single frame

Image format:

MRC

No. of images or tilt series:

3972

Image size:

(4096, 4096)

Pixel type:

32 BIT FLOAT

Pixel spacing:

(0.7445, 0.7445)

Details:

fOM dataset 1

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3. Motion-corrected and dose-weighted micrographs of UBR5-fOM dataset with no tilt

Category:

micrographs - single frame

Image format:

MRC

No. of images or tilt series:

4368

Image size:

(4096, 4096)

Pixel type:

32 BIT FLOAT

Pixel spacing:

(0.7445, 0.7445)

Details:

fOM dataset2, untilted

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4. Motion-corrected and dose-weighted micrographs of UBR5-fOM dataset with 30degree tilt

Category:

micrographs - single frame

Image format:

MRC

No. of images or tilt series:

3094

Image size:

(4096, 4096)

Pixel type:

32 BIT FLOAT

Pixel spacing:

(0.7445, 0.7445)

Details:

fOM dataset2, tilted

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5. Motion-corrected and dose-weighted micrographs of UBR5-fOM dataset 3

Category:

micrographs - single frame

Image format:

MRC

No. of images or tilt series:

14264

Image size:

(4096, 4096)

Pixel type:

32 BIT FLOAT

Pixel spacing:

(0.951, 0.951)

Details:

Large fOM dataset 3

Files:

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Citations

Structural basis for HIV-1 antagonism of host APOBEC3G via Cullin E3 ligase.

Ito F, Alvarez-Cabrera AL, Liu S, Yang H, Shiriaeva A, Zhou ZH, Chen XS. (2023)

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Rigden DJ, Fernández XM. (2023)

EMPIAR: the Electron Microscopy Public Image Archive.

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