EMPIAR-11487 - Single particle cryo-EM dataset of extended cowpea chlorotic mottle virus in plunge-frozen vitrified ice [multiple data sets in EER format]

EMPIAR-11487

Single particle cryo-EM dataset of extended cowpea chlorotic mottle virus in plunge-frozen vitrified ice [multiple data sets in EER format]

Publication:

Fast viral dynamics revealed by microsecond time-resolved cryo-EM

Harder OF, Barrass SV, Drabbels M, Lorenz UJ

Nature communications 14 (2023)

PMID: 37704664

DOI: 10.1038/s41467-023-41444-x

Related EMDB entry:

EMD-16790

Deposited:

2023-03-01

Released:

2023-11-07

Last modified:

2023-11-07

Imageset size:

5.11 TB

Imageset DOI:

10.6019/EMPIAR-11487

Experimental metadata:

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Contains:

micrographs - multiframe

Image Sets

1. Single particle cryo-EM dataset of extended cowpea chlorotic mottle virus in plunge-frozen vitrified ice, grid 1

Category:

micrographs - multiframe

Image format:

EER

No. of images or tilt series:

5391

Image size:

(4096, 4096)

Pixel type:

BIT

Pixel spacing:

(0.726, 0.726)

Details:

These are the EER files from Falcon 4 detector - raw micrographs, not motion corrected.

Samples of expanded CCMV are prepared at pH 7.6 in the absence of divalent ions and plunge frozen in the presence of a photoacid (NPE-caged proton). The pH of the sample is then lowered to 4.5 by releasing the photoacid with UV irradiation (266 nm).

Files:

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rsync -av --files-from=(path-to-filelist) rsync://empiar.pdbj.org/empiar/archive (path-to-destination)

2. Single particle cryo-EM dataset of extended cowpea chlorotic mottle virus in plunge-frozen vitrified ice, grid 2

Category:

micrographs - multiframe

Image format:

EER

No. of images or tilt series:

5235

Image size:

(4096, 4096)

Pixel type:

BIT

Pixel spacing:

(0.726, 0.726)

Details:

Files:

選択したファイルを無圧縮zipファイルにアーカイブ化してダウンロードします。

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rsyncコマンド等でファイルリストを指定してダウンロードすることが可能です。

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