EMPIAR-11472 - Single particle cryo-EM dataset of human nucleolar and nuclear pre-60S assembly intermediates [multiple data sets in TIFF and MRCS formats]

EMPIAR-11472

Single particle cryo-EM dataset of human nucleolar and nuclear pre-60S assembly intermediates [multiple data sets in TIFF and MRCS formats]

Publication:

Principles of human pre-60S biogenesis

Vanden Broeck A, Klinge S

Science (New York, N.Y.) 381 (2023)

PMID: 37410842

DOI: 10.1126/science.adh3892

Related EMDB entry:

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Deposited:

2022-12-06

Released:

2023-09-26

Last modified:

2023-09-26

Imageset size:

140.46 TB

Imageset DOI:

10.6019/EMPIAR-11472

Experimental metadata:

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Contains:

micrographs - multiframe
micrographs - single frame

Image Sets

1. Unaligned multi-frame micrographs of human nucleolar and nuclear pre-60S assembly intermediates - Dataset 1

Category:

micrographs - multiframe

Image format:

TIFF

No. of images or tilt series:

44352

Image size:

(11520, 8184)

Pixel type:

UNSIGNED BYTE

Pixel spacing:

(0.54, 0.54)

Details:

The dataset was collected on a Titan Krios electron microscope operating at 300 kV equipped with an energy filter (slit width 20 eV), a Cs corrector and a K3 Summit detector set in super-resolution mode. Unaligned multi-frame micrographs were recorded at a nominal magnification of 64,000× with a pixel size of 0.54 Å/pixel, a defocus range of -0.5 to -2.5 µm, and a total dose of 60.0 e-/Å2 (40 frames). The gain reference was applied on-the-fly during data collection.

Files:

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2. Unaligned multi-frame micrographs of human nucleolar and nuclear pre-60S assembly intermediates - Dataset 2

Category:

micrographs - multiframe

Image format:

TIFF

No. of images or tilt series:

45846

Image size:

(11520, 8184)

Pixel type:

UNSIGNED BYTE

Pixel spacing:

(0.54, 0.54)

Details:

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3. Unaligned multi-frame micrographs of human nucleolar and nuclear pre-60S assembly intermediates - Dataset 3

Category:

micrographs - multiframe

Image format:

TIFF

No. of images or tilt series:

44335

Image size:

(11520, 8184)

Pixel type:

UNSIGNED BYTE

Pixel spacing:

(0.54, 0.54)

Details:

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4. Unaligned multi-frame micrographs of human nucleolar and nuclear pre-60S assembly intermediates - Dataset 4

Category:

micrographs - multiframe

Image format:

TIFF

No. of images or tilt series:

37166

Image size:

(11520, 8184)

Pixel type:

UNSIGNED BYTE

Pixel spacing:

(0.54, 0.54)

Details:

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5. Polished particle stack of human nucleolar and nuclear pre-60S assembly intermediates

Category:

micrographs - single frame

Image format:

MRCS

No. of images or tilt series:

2474967

Image size:

(480, 480)

Pixel type:

32 BIT FLOAT

Pixel spacing:

(1.08, 1.08)

Details:

Merged set of pre-60S particles from four datasets. Particles are polished, magnification anisotropy corrected and per-particle defocus corrected. A Relion .star format file is provided and contains the final Euler angles, shifts and also the micrograph coordinates.

Files:

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Citations

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