EMPIAR-11283 - LRRC8A-BRIL:C Heteromer in GDN [multiple data sets in TIFF and MRCS formats]

EMPIAR-11283

LRRC8A-BRIL:C Heteromer in GDN [multiple data sets in TIFF and MRCS formats]

Publication:

Structural basis for assembly and lipid-mediated gating of LRRC8A:C volume-regulated anion channels

Kern DM, Bleier J, Mukherjee S, Hill JM, Kossiakoff AA, Isacoff EY, Brohawn SG

bioRxiv (2022)

PMID: 30775971

DOI: 10.1101/2022.07.31.502239

Related EMDB entry:

EMD-27675 EMD-27682 EMD-27676 EMD-27677 EMD-27674 EMD-27678 EMD-27681 EMD-27679

Deposited:

2022-08-02

Released:

2023-04-12

Last modified:

2023-04-13

Imageset size:

8.93 TB

Imageset DOI:

10.6019/EMPIAR-11283

Experimental metadata:

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Contains:

micrographs - multiframe
picked particles - multiframe - processed

Image Sets

1. Unaligned tif movies for LRRC8ABRIL:C in 150 mM KCl

Category:

micrographs - multiframe

Image format:

TIFF

No. of images or tilt series:

8261

Image size:

(11520, 8184)

Pixel type:

UNSIGNED BYTE

Pixel spacing:

(0.524, 0.524)

Details:

Gain reference in dm4 and mrc form is included in the folder with the movies. In RELION, the gain must be flipped upside down. To match our motion correction settings, use 1.076 e/Å2 dose per frame and use bin 2 to produce mrc at the physical pixel size of 1.048Å/px.

Files:

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2. Unaligned tif movies for LRRC8ABRIL:C in 75 mM KCl

Category:

micrographs - multiframe

Image format:

TIFF

No. of images or tilt series:

7208

Image size:

(11520, 8184)

Pixel type:

UNSIGNED BYTE

Pixel spacing:

(0.524, 0.524)

Details:

Gain reference in dm4 and mrc form is included in the folder with the movies. In RELION, the gain must be flipped upside down. To match our motion correction settings, use 0.9953 e/Å2 dose per frame and use bin 2 to produce mrc at the physical pixel size of 1.048Å/px.

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3. Pooled polished particles stacks for LRRC8A-BRIL/C in GDN

Category:

picked particles - multiframe - processed

Image format:

MRCS

No. of images or tilt series:

11609

Image size:

(416, 416)

Pixel type:

UNSIGNED BYTE

Pixel spacing:

(1.048, 1.048)

Details:

Contains polished particles (437,174) as 11,609 mrcs files from the pooled GDN samples (75 and 150 mM KCl). The selections of particles for each conformation (1 and 2) are in the main data folder. They are in RELION star format and can be imported into cryoSPARC as well for processing.

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