EMPIAR-11168 - Structure of SARS-CoV-2 membrane protein [multiple data sets in TIFF format]

EMPIAR-11168

Structure of SARS-CoV-2 membrane protein [multiple data sets in TIFF format]

Publication:

Structure of SARS-CoV-2 membrane protein essential for virus assembly

Zhang Z, Nomura N, Muramoto Y, Ekimoto T, Uemura T, Liu K, Yui M, Kono N, Aoki J, Ikeguchi M, Noda T, Iwata S, Ohto U, Shimizu T

Nature communications 13 (2022)

PMID: 35931673

DOI: 10.1038/s41467-022-32019-3

Related EMDB entry:

EMD-31977 EMD-31978 EMD-31976

Deposited:

2022-08-16

Released:

2022-09-09

Last modified:

2022-09-23

Imageset size:

4.37 TB

Imageset DOI:

10.6019/EMPIAR-11168

Experimental metadata:

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Deposited via PDBj

Contains:

micrographs - multiframe

Image Sets

1. M protein (LMNG/CHS)

Category:

micrographs - multiframe

Image format:

TIFF

No. of images or tilt series:

6055

Image size:

(5760, 4092)

Pixel type:

UNSIGNED BYTE

Pixel spacing:

(0.83, 0.83)

Details:

HT: 300 kV
Cs: 2.7 mm
Flux: 0.96 e/Å2/frame
Please use 'CountRef_112-1_0000_Jan07_20.02.08.mrc' as a gain reference without rotation or flipping.
NB: The pixel size in the TIFF header is not correct.
Four digits (0000 to 0008) in the movie file names represent the directions of beam shifts applied during data collection.

Files:

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rsync -av --files-from=(path-to-filelist) rsync://empiar.pdbj.org/empiar/archive (path-to-destination)

2. M protein (LMNG/CHS) + Fab-E

Category:

micrographs - multiframe

Image format:

TIFF

No. of images or tilt series:

5562

Image size:

(5760, 4092)

Pixel type:

UNSIGNED BYTE

Pixel spacing:

(0.83, 0.83)

Details:

HT: 300 kV
Cs: 2.7 mm
Flux: 0.97 e/Å2/frame
Please use 'CountCDSRef_ja_139-1_0000_May21_22.27.44.mrc' as a gain reference without rotation or flipping.
Four digits (0000 to 0008) in the movie file names represent the directions of beam shifts applied during data collection.

Files:

選択したファイルを無圧縮zipファイルにアーカイブ化してダウンロードします。

rsync、aspera、globus 等の利用をおすすめします。

選択したファイルのリストをダウンロードします。

rsyncコマンド等でファイルリストを指定してダウンロードすることが可能です。

rsync -av --files-from=(path-to-filelist) rsync://empiar.pdbj.org/empiar/archive (path-to-destination)

3. M protein (LMNG/CHS) + Fab-B

Category:

micrographs - multiframe

Image format:

TIFF

No. of images or tilt series:

3519

Image size:

(5760, 4092)

Pixel type:

UNSIGNED BYTE

Pixel spacing:

(0.83, 0.83)

Details:

HT: 300 kV
Cs: 2.7 mm
Flux: 0.96 e/Å2/frame
Please use 'CountCDSRef_ja_145-1_0000_May27_23.14.16.mrc' as a gain reference without rotation or flipping.
Four digits (0000 to 0008) in the movie file names represent the directions of beam shifts applied during data collection.

Files:

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rsyncコマンド等でファイルリストを指定してダウンロードすることが可能です。

rsync -av --files-from=(path-to-filelist) rsync://empiar.pdbj.org/empiar/archive (path-to-destination)

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[2026-06-24]

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