EMPIAR-11076 - Single particle cryo-EM dataset of the Paranosema locustae ribosome bound to Lso2 [multiple data sets in MRC format]

EMPIAR-11076

Single particle cryo-EM dataset of the Paranosema locustae ribosome bound to Lso2 [multiple data sets in MRC format]

Publication:

Differences in structure and hibernation mechanism highlight diversification of the microsporidian ribosome

Ehrenbolger K, Jespersen N, Sharma H, Sokolova YY, Tokarev YS, Vossbrinck CR, Barandun J

PLoS biology 18 (2020)

PMID: 33125369

DOI: 10.1371/journal.pbio.3000958

Related EMDB entry:

EMD-11437

Deposited:

2021-09-02

Released:

2022-08-09

Last modified:

2022-08-09

Imageset size:

1.96 TB

Imageset DOI:

10.6019/EMPIAR-11076

Experimental metadata:

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Contains:

micrographs - multiframe

Image Sets

1. Unaligned multi-frame micrographs of the Paranosema locustae Lso2-ribosome complex - 20 frames

Category:

micrographs - multiframe

Image format:

MRC

No. of images or tilt series:

3078

Image size:

(3838, 3710)

Pixel type:

UNSIGNED BYTE

Pixel spacing:

(1.041, 1.041)

Details:

Micrographs were collected at the Umeå Core Facility for Electron Microscopy on a Titan Krios (Thermo Fisher Scientific) operated at 300 kV, equipped with a Gatan K2 BioQuantum direct electron detector. EPU (Thermo Fisher Scientific) was used for the automated data collection of a total of 3078 movies with 20 frames at a total
dose of 28.6 e−/Å2, a pixel size of 1.041 Å, and a defocus range between 0.7 and 2 μm.

Files:

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2. Unaligned multi-frame micrographs of the Paranosema locustae Lso2-ribosome complex - 40 frames

Category:

micrographs - multiframe

Image format:

MRC

No. of images or tilt series:

2254

Image size:

(3838, 3710)

Pixel type:

UNSIGNED BYTE

Pixel spacing:

(1.041, 1.041)

Details:

Micrographs were collected at the Umeå Core Facility for Electron Microscopy on a Titan Krios (Thermo Fisher Scientific) operated at 300 kV, equipped with a Gatan K2 BioQuantum direct electron detector. EPU (Thermo Fisher Scientific) was used for the automated data collection of a total of 2254 movies with 40 frames at a total
dose of 28.6 e−/Å2, a pixel size of 1.041 Å, and a defocus range between 0.7 and 2 μm.

Files:

選択したファイルを無圧縮zipファイルにアーカイブ化してダウンロードします。

rsync、aspera、globus 等の利用をおすすめします。

選択したファイルのリストをダウンロードします。

rsyncコマンド等でファイルリストを指定してダウンロードすることが可能です。

rsync -av --files-from=(path-to-filelist) rsync://empiar.pdbj.org/empiar/archive (path-to-destination)

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Citations

Small LEA proteins mitigate air-water interface damage to fragile cryo-EM samples during plunge freezing.

Abe KM, Li G, He Q, Grant T, Lim CJ. (2024)

Outer membrane protein assembly mediated by BAM-SurA complexes.

Fenn KL, Horne JE, Crossley JA, Böhringer N, Horne RJ, Schäberle TF, Calabrese AN, Radford SE, Ranson NA. (2024)

Ubiquitinated histone H2B as gatekeeper of the nucleosome acidic patch.

Hicks CW, Rahman S, Gloor SL, Fields JK, Husby NL, Vaidya A, Maier KE, Morgan M, Keogh MC, Wolberger C. (2024)

Molecular recognition of an odorant by the murine trace amine-associated receptor TAAR7f.

Gusach A, Lee Y, Khoshgrudi AN, Mukhaleva E, Ma N, Koers EJ, Chen Q, Edwards PC, Huang F, Kim J, Mancia F, Veprintsev DB, Vaidehi N, Weyand SN, Tate CG. (2024)

The novel ribosome biogenesis inhibitor usnic acid blocks nucleolar pre-60S maturation.

Kofler L, Grundmann L, Gerhalter M, Prattes M, Merl-Pham J, Zisser G, Grishkovskaya I, Hodirnau VV, Vareka M, Breinbauer R, Hauck SM, Haselbach D, Bergler H. (2024)

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