EMPIAR-11044 - Single cell chemistry of photoactivatable platinum anticancer complexes [multiple data sets in MRC and TIFF formats]

EMPIAR-11044

Single cell chemistry of photoactivatable platinum anticancer complexes [multiple data sets in MRC and TIFF formats]

Publication:

Single-Cell Chemistry of Photoactivatable Platinum Anticancer Complexes

Bolitho EM, Sanchez-Cano C, Shi H, Quinn PD, Harkiolaki M, Imberti C, Sadler PJ

Journal of the American Chemical Society 143 (2021) 20224-20240

PMID: 34808054

DOI: 10.1021/jacs.1c08630

Related EMDB entry:

Deposited:

2021-04-07

Released:

2025-04-07

Last modified:

2025-04-07

Imageset size:

43.89 GB

Imageset DOI:

10.6019/EMPIAR-11044

Experimental metadata:

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Contains:

tilt series

Image Sets

1. Tomogram 1 (T1) - Tilt series of cryopreserved PC3 cell grown on Quantifoil TEM grids exposed to dark conditions for 2 h

Category:

tilt series

Image format:

MRC

No. of images or tilt series:

Image size:

(946, 946)

Pixel type:

UNSIGNED 16 BIT INTEGER

Pixel spacing:

(15.8, 15.8)

Details:

Tomogram 1 (T1) - Tilt series of cryopreserved PC3 cell grown on Quantifoil TEM grids exposed to dark conditions for 2 h.

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2. Tomogram 2 (T2) - Tilt series of cryopreserved PC3 cell grown on Quantifoil TEM grids exposed to dark conditions for 2 h

Category:

tilt series

Image format:

MRC

No. of images or tilt series:

Image size:

(946, 946)

Pixel type:

UNSIGNED 16 BIT INTEGER

Pixel spacing:

(158.0, 158.0)

Details:

Tomogram 2 (T2) - Tilt series of cryopreserved PC3 cell grown on Quantifoil TEM grids exposed to dark conditions for 2 h.

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3. Tomogram 2 (T2) - Tilt series of cryopreserved PC3 cell grown on Quantifoil TEM grids exposed to dark conditions for 2 h

Category:

tilt series

Image format:

TIFF

No. of images or tilt series:

Image size:

(946, 946)

Pixel type:

UNSIGNED 16 BIT INTEGER

Pixel spacing:

(158.0, 158.0)

Details:

Tomogram 2 (T2) - Tilt series of cryopreserved PC3 cell grown on Quantifoil TEM grids exposed to dark conditions for 2 h.

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4. Tomogram 1 (T1) - Tilt series of cryopreserved PC3 cell grown on Quantifoil TEM grids exposed to dark conditions for 2 h

Category:

tilt series

Image format:

TIFF

No. of images or tilt series:

Image size:

(946, 946)

Pixel type:

UNSIGNED 16 BIT INTEGER

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(158.0, 158.0)

Details:

Tomogram 1 (T1) - Tilt series of cryopreserved PC3 cell grown on Quantifoil TEM grids exposed to dark conditions for 2 h.

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5. Tomogram 3 (T3) - Tilt series of cryopreserved PC3 cell grown on Quantifoil TEM grids exposed to dark conditions for 2 h

Category:

tilt series

Image format:

MRC

No. of images or tilt series:

Image size:

(946, 946)

Pixel type:

UNSIGNED 16 BIT INTEGER

Pixel spacing:

(158.0, 158.0)

Details:

Tomogram 3 (T3) - Tilt series of cryopreserved PC3 cell grown on Quantifoil TEM grids exposed to dark conditions for 2 h.

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6. Tomogram 3 (T3) - Tilt series of cryopreserved PC3 cell grown on Quantifoil TEM grids exposed to dark conditions for 2 h

Category:

tilt series

Image format:

TIFF

No. of images or tilt series:

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(946, 946)

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UNSIGNED 16 BIT INTEGER

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(158.0, 158.0)

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Tomogram 3 (T3) - Tilt series of cryopreserved PC3 cell grown on Quantifoil TEM grids exposed to dark conditions for 2 h.

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7. Tomogram 4 (T4) - Tilt series of cryopreserved PC3 cell grown on Quantifoil TEM grids exposed to 1 h irradiation (blue light, λ=465 nm)

Category:

tilt series

Image format:

MRC

No. of images or tilt series:

Image size:

(946, 946)

Pixel type:

UNSIGNED 16 BIT INTEGER

Pixel spacing:

(158.0, 158.0)

Details:

Tomogram 4 (T4) - Tilt series of cryopreserved PC3 cell grown on Quantifoil TEM grids exposed to 1 h irradiation (blue light, λ=465 nm).

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8. Tomogram 4 (T4) - Tilt series of cryopreserved PC3 cell grown on Quantifoil TEM grids exposed to 1 h irradiation (blue light, λ=465 nm)

Category:

tilt series

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TIFF

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(946, 946)

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UNSIGNED 16 BIT INTEGER

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Tomogram 4 (T4) - Tilt series of cryopreserved PC3 cell grown on Quantifoil TEM grids exposed to 1 h irradiation (blue light, λ=465 nm).

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9. Tomogram 5 (T5) - Tilt series of cryopreserved PC3 cell grown on Quantifoil TEM grids exposed to 1 h irradiation (blue light, λ=465 nm)

Category:

tilt series

Image format:

MRC

No. of images or tilt series:

Image size:

(946, 946)

Pixel type:

UNSIGNED 16 BIT INTEGER

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(158.0, 158.0)

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Tomogram 5 (T5) - Tilt series of cryopreserved PC3 cell grown on Quantifoil TEM grids exposed to 1 h irradiation (blue light, λ=465 nm).

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10. Tomogram 5 (T5) - Tilt series of cryopreserved PC3 cell grown on Quantifoil TEM grids exposed to 1 h irradiation (blue light, λ=465 nm)

Category:

tilt series

Image format:

TIFF

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(946, 946)

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UNSIGNED 16 BIT INTEGER

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(158.0, 158.0)

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Tomogram 5 (T5) - Tilt series of cryopreserved PC3 cell grown on Quantifoil TEM grids exposed to 1 h irradiation (blue light, λ=465 nm).

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11. Tomogram 6 (T6) - Tilt series of cryopreserved PC3 cell grown on Quantifoil TEM grids exposed to 1 h irradiation (blue light, λ=465 nm)

Category:

tilt series

Image format:

MRC

No. of images or tilt series:

Image size:

(946, 946)

Pixel type:

UNSIGNED 16 BIT INTEGER

Pixel spacing:

(158.0, 158.0)

Details:

Tomogram 6 (T6) - Tilt series of cryopreserved PC3 cell grown on Quantifoil TEM grids exposed to 1 h irradiation (blue light, λ=465 nm).

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12. Tomogram 6 (T6) - Tilt series of cryopreserved PC3 cell grown on Quantifoil TEM grids exposed to 1 h irradiation (blue light, λ=465 nm)

Category:

tilt series

Image format:

TIFF

No. of images or tilt series:

Image size:

(946, 946)

Pixel type:

UNSIGNED 16 BIT INTEGER

Pixel spacing:

(158.0, 158.0)

Details:

Tomogram 6 (T6)- Reconstructed tomogram of cryopreserved PC3 cell grown on Quantifoil TEM grids exposed to 1 h irradiation (blue light, λ=465 nm).

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13. Tomogram 7 (T7) - Tilt series of cryopreserved PC3 cell grown on Quantifoil TEM grids treated with 1x photo IC50 of Pt2 for 2 h (protected from light)

Category:

tilt series

Image format:

MRC

No. of images or tilt series:

Image size:

(946, 946)

Pixel type:

UNSIGNED 16 BIT INTEGER

Pixel spacing:

(158.0, 158.0)

Details:

Tomogram 7 (T7) - Tilt series of cryopreserved PC3 cell grown on Quantifoil TEM grids treated with 1x photo IC50 of Pt2 for 2 h (protected from light)

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14. Tomogram 7 (T7) - Tilt series of cryopreserved PC3 cell grown on Quantifoil TEM grids treated with 1x photo IC50 of Pt2 for 2 h (protected from light)

Category:

tilt series

Image format:

TIFF

No. of images or tilt series:

Image size:

(946, 946)

Pixel type:

UNSIGNED 16 BIT INTEGER

Pixel spacing:

(158.0, 158.0)

Details:

Tomogram 7 (T7) - Tilt series of cryopreserved PC3 cell grown on Quantifoil TEM grids treated with 1x photo IC50 of Pt2 for 2 h (protected from light)

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15. Tomogram 1 (T1) - Tilt series of cryopreserved PC3 cell grown on Quantifoil TEM grids exposed to dark conditions for 2 h

Category:

tilt series

Image format:

TIFF

No. of images or tilt series:

Image size:

(946, 946)

Pixel type:

UNSIGNED 16 BIT INTEGER

Pixel spacing:

(None, None)

Details:

Tomogram 1 (T1) - Tilt series of cryopreserved PC3 cell grown on Quantifoil TEM grids exposed to dark conditions for 2 h

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16. Tomogram 8 (T8) - Tilt series of cryopreserved PC3 cell grown on Quantifoil TEM grids treated with 1x photo IC50 of Pt2 for 2 h (protected from light)

Category:

tilt series

Image format:

MRC

No. of images or tilt series:

Image size:

(946, 946)

Pixel type:

UNSIGNED 16 BIT INTEGER

Pixel spacing:

(158.0, 158.0)

Details:

Tomogram 8 (T8) - Tilt series of cryopreserved PC3 cell grown on Quantifoil TEM grids treated with 1x photo IC50 of Pt2 for 2 h (protected from light)

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17. Tomogram 8 (T8) - Tilt series of cryopreserved PC3 cell grown on Quantifoil TEM grids treated with 1x photo IC50 of Pt2 for 2 h (protected from light)

Category:

tilt series

Image format:

TIFF

No. of images or tilt series:

Image size:

(946, 946)

Pixel type:

UNSIGNED 16 BIT INTEGER

Pixel spacing:

(158.0, 158.0)

Details:

Tomogram 8 (T8) - Tilt series of cryopreserved PC3 cell grown on Quantifoil TEM grids treated with 1x photo IC50 of Pt2 for 2 h (protected from light)

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18. Tomogram 9 (T9) - Tilt series of cryopreserved PC3 cell grown on Quantifoil TEM grids treated with 1x photo IC50 of Pt2 for 2 h (protected from light)

Category:

tilt series

Image format:

MRC

No. of images or tilt series:

Image size:

(946, 946)

Pixel type:

UNSIGNED 16 BIT INTEGER

Pixel spacing:

(158.0, 158.0)

Details:

Tomogram 9 (T9) - Tilt series of cryopreserved PC3 cell grown on Quantifoil TEM grids treated with 1x photo IC50 of Pt2 for 2 h (protected from light)

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19. Tomogram 9 (T9) - Tilt series of cryopreserved PC3 cell grown on Quantifoil TEM grids treated with 1x photo IC50 of Pt2 for 2 h (protected from light)

Category:

tilt series

Image format:

TIFF

No. of images or tilt series:

Image size:

(946, 946)

Pixel type:

UNSIGNED 16 BIT INTEGER

Pixel spacing:

(158.0, 158.0)

Details:

Tomogram 9 (T9) - Tilt series of cryopreserved PC3 cell grown on Quantifoil TEM grids treated with 1x photo IC50 of Pt2 for 2 h (protected from light)

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20. Tomogram 10 (T10) - Tilt series of cryopreserved PC3 cell grown on Quantifoil TEM grids treated with 0.25x photo IC50 of Pt2 for 1 h followed by 1 irradiation (blue light, λ=465 nm)

Category:

tilt series

Image format:

MRC

No. of images or tilt series:

Image size:

(946, 946)

Pixel type:

UNSIGNED 16 BIT INTEGER

Pixel spacing:

(158.0, 158.0)

Details:

Tomogram 10 (T10) - Tilt series of cryopreserved PC3 cell grown on Quantifoil TEM grids treated with 0.25x photo IC50 of Pt2 for 1 h followed by 1 irradiation (blue light, λ=465 nm)

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21. Tomogram 10 (T10) - Tilt series of cryopreserved PC3 cell grown on Quantifoil TEM grids treated with 0.25x photo IC50 of Pt2 for 1 h followed by 1 irradiation (blue light, λ=465 nm)

Category:

tilt series

Image format:

TIFF

No. of images or tilt series:

Image size:

(946, 946)

Pixel type:

UNSIGNED 16 BIT INTEGER

Pixel spacing:

(158.0, 158.0)

Details:

Tomogram 10 (T10) - Tilt series of cryopreserved PC3 cell grown on Quantifoil TEM grids treated with 0.25x photo IC50 of Pt2 for 1 h followed by 1 irradiation (blue light, λ=465 nm)

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22. Tomogram 11 (T11) - Tilt series of cryopreserved PC3 cell grown on Quantifoil TEM grids treated with 0.25x photo IC50 of Pt2 for 1 h followed by 1 irradiation (blue light, λ=465 nm)

Category:

tilt series

Image format:

MRC

No. of images or tilt series:

Image size:

(946, 946)

Pixel type:

UNSIGNED 16 BIT INTEGER

Pixel spacing:

(158.0, 158.0)

Details:

Tomogram 11 (T11) - Tilt series of cryopreserved PC3 cell grown on Quantifoil TEM grids treated with 0.25x photo IC50 of Pt2 for 1 h followed by 1 irradiation (blue light, λ=465 nm)

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23. Tomogram 11 (T11) - Tilt series of cryopreserved PC3 cell grown on Quantifoil TEM grids treated with 0.25x photo IC50 of Pt2 for 1 h followed by 1 irradiation (blue light, λ=465 nm)

Category:

tilt series

Image format:

TIFF

No. of images or tilt series:

Image size:

(946, 946)

Pixel type:

UNSIGNED 16 BIT INTEGER

Pixel spacing:

(158.0, 158.0)

Details:

Tomogram 11 (T11) - Tilt series of cryopreserved PC3 cell grown on Quantifoil TEM grids treated with 0.25x photo IC50 of Pt2 for 1 h followed by 1 irradiation (blue light, λ=465 nm)

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24. Tomogram 12 (T12) - Tilt series of cryopreserved PC3 cell grown on Quantifoil TEM grids treated with 0.25x photo IC50 of Pt2 for 1 h followed by 1 irradiation (blue light, λ=465 nm)

Category:

tilt series

Image format:

TIFF

No. of images or tilt series:

Image size:

(946, 946)

Pixel type:

UNSIGNED 16 BIT INTEGER

Pixel spacing:

(158.0, 158.0)

Details:

Tomogram 12 (T12) - Tilt series of cryopreserved PC3 cell grown on Quantifoil TEM grids treated with 0.25x photo IC50 of Pt2 for 1 h followed by 1 irradiation (blue light, λ=465 nm)

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25. Tomogram 12 (T12) - Tilt series of cryopreserved PC3 cell grown on Quantifoil TEM grids treated with 0.25x photo IC50 of Pt2 for 1 h followed by 1 irradiation (blue light, λ=465 nm)

Category:

tilt series

Image format:

MRC

No. of images or tilt series:

Image size:

(946, 946)

Pixel type:

UNSIGNED 16 BIT INTEGER

Pixel spacing:

(158.0, 158.0)

Details:

Tomogram 12 (T12) - Tilt series of cryopreserved PC3 cell grown on Quantifoil TEM grids treated with 0.25x photo IC50 of Pt2 for 1 h followed by 1 irradiation (blue light, λ=465 nm)

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26. Tomogram 13 (T13) - Tilt series of cryopreserved PC3 cell grown on Quantifoil TEM grids treated with 0.5x photo IC50 of Pt2 for 1 h followed by 1 irradiation (blue light, λ=465 nm)

Category:

tilt series

Image format:

MRC

No. of images or tilt series:

Image size:

(946, 946)

Pixel type:

UNSIGNED 16 BIT INTEGER

Pixel spacing:

(158.0, 158.0)

Details:

Tomogram 13 (T13) - Tilt series of cryopreserved PC3 cell grown on Quantifoil TEM grids treated with 0.25x photo IC50 of Pt2 for 1 h followed by 1 irradiation (blue light, λ=465 nm)

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27. Tomogram 13 (T13) - Tilt series of cryopreserved PC3 cell grown on Quantifoil TEM grids treated with 0.5x photo IC50 of Pt2 for 1 h followed by 1 irradiation (blue light, λ=465 nm)

Category:

tilt series

Image format:

TIFF

No. of images or tilt series:

Image size:

(946, 946)

Pixel type:

UNSIGNED 16 BIT INTEGER

Pixel spacing:

(158.0, 158.0)

Details:

Tomogram 13 (T13) - Tilt series of cryopreserved PC3 cell grown on Quantifoil TEM grids treated with 0.25x photo IC50 of Pt2 for 1 h followed by 1 irradiation (blue light, λ=465 nm)

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28. Tomogram 14 (T14) - Tilt series of cryopreserved PC3 cell grown on Quantifoil TEM grids treated with 0.5x photo IC50 of Pt2 for 1 h followed by 1 irradiation (blue light, λ=465 nm)

Category:

tilt series

Image format:

MRC

No. of images or tilt series:

Image size:

(946, 946)

Pixel type:

UNSIGNED 16 BIT INTEGER

Pixel spacing:

(158.0, 158.0)

Details:

Tomogram 14 (T14) - Tilt series of cryopreserved PC3 cell grown on Quantifoil TEM grids treated with 0.55x photo IC50 of Pt2 for 1 h followed by 1 irradiation (blue light, λ=465 nm)

Files:

選択したファイルを無圧縮zipファイルにアーカイブ化してダウンロードします。

rsync、aspera、globus 等の利用をおすすめします。

選択したファイルのリストをダウンロードします。

rsyncコマンド等でファイルリストを指定してダウンロードすることが可能です。

rsync -av --files-from=(path-to-filelist) rsync://empiar.pdbj.org/empiar/archive (path-to-destination)

29. Tomogram 14 (T14) - Tilt series of cryopreserved PC3 cell grown on Quantifoil TEM grids treated with 0.5x photo IC50 of Pt2 for 1 h followed by 1 irradiation (blue light, λ=465 nm)

Category:

tilt series

Image format:

TIFF

No. of images or tilt series:

Image size:

(946, 946)

Pixel type:

UNSIGNED 16 BIT INTEGER

Pixel spacing:

(158.0, 158.0)

Details:

Tomogram 14 (T14) - Tilt series of cryopreserved PC3 cell grown on Quantifoil TEM grids treated with 0.5x photo IC50 of Pt2 for 1 h followed by 1 irradiation (blue light, λ=465 nm)

Files:

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rsync -av --files-from=(path-to-filelist) rsync://empiar.pdbj.org/empiar/archive (path-to-destination)

30. Tomogram 15 (T15) - Tilt series of cryopreserved PC3 cell grown on Quantifoil TEM grids treated with 1x photo IC50 of Pt2 for 1 h followed by 1 irradiation (blue light, λ=465 nm)

Category:

tilt series

Image format:

MRC

No. of images or tilt series:

Image size:

(946, 946)

Pixel type:

UNSIGNED 16 BIT INTEGER

Pixel spacing:

(158.0, 158.0)

Details:

Tomogram 15 (T15) - Tilt series of cryopreserved PC3 cell grown on Quantifoil TEM grids treated with 1x photo IC50 of Pt2 for 1 h followed by 1 irradiation (blue light, λ=465 nm)

Files:

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rsync -av --files-from=(path-to-filelist) rsync://empiar.pdbj.org/empiar/archive (path-to-destination)

31. Tomogram 15 (T15) - Tilt series of cryopreserved PC3 cell grown on Quantifoil TEM grids treated with 1x photo IC50 of Pt2 for 1 h followed by 1 irradiation (blue light, λ=465 nm)

Category:

tilt series

Image format:

TIFF

No. of images or tilt series:

Image size:

(946, 946)

Pixel type:

UNSIGNED 16 BIT INTEGER

Pixel spacing:

(158.0, 158.0)

Details:

Tomogram 15 (T15) - Tilt series of cryopreserved PC3 cell grown on Quantifoil TEM grids treated with 1x photo IC50 of Pt2 for 1 h followed by 1 irradiation (blue light, λ=465 nm)

Files:

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rsync -av --files-from=(path-to-filelist) rsync://empiar.pdbj.org/empiar/archive (path-to-destination)

32. Tomogram 16 (T16) - Tilt series of cryopreserved PC3 cell grown on Quantifoil TEM grids treated with 1x photo IC50 of Pt2 for 1 h followed by 1 irradiation (blue light, λ=465 nm)

Category:

tilt series

Image format:

MRC

No. of images or tilt series:

Image size:

(946, 946)

Pixel type:

UNSIGNED 16 BIT INTEGER

Pixel spacing:

(158.0, 158.0)

Details:

Tomogram 16 (T16) - Tilt series of cryopreserved PC3 cell grown on Quantifoil TEM grids treated with 1x photo IC50 of Pt2 for 1 h followed by 1 irradiation (blue light, λ=465 nm)

Files:

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rsync -av --files-from=(path-to-filelist) rsync://empiar.pdbj.org/empiar/archive (path-to-destination)

33. Tomogram 16 (T16) - Tilt series of cryopreserved PC3 cell grown on Quantifoil TEM grids treated with 1x photo IC50 of Pt2 for 1 h followed by 1 irradiation (blue light, λ=465 nm)

Category:

tilt series

Image format:

TIFF

No. of images or tilt series:

Image size:

(946, 946)

Pixel type:

UNSIGNED 16 BIT INTEGER

Pixel spacing:

(158.0, 158.0)

Details:

Tomogram 16 (T16) - Tilt series of cryopreserved PC3 cell grown on Quantifoil TEM grids treated with 1x photo IC50 of Pt2 for 1 h followed by 1 irradiation (blue light, λ=465 nm)

Files:

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rsync -av --files-from=(path-to-filelist) rsync://empiar.pdbj.org/empiar/archive (path-to-destination)

34. Tomogram 17 (T17) - Tilt series of cryopreserved PC3 cell grown on Quantifoil TEM grids treated with 1x photo IC50 of Pt2 for 1 h followed by 1 irradiation (blue light, λ=465 nm)

Category:

tilt series

Image format:

MRC

No. of images or tilt series:

Image size:

(946, 946)

Pixel type:

UNSIGNED 16 BIT INTEGER

Pixel spacing:

(158.0, 158.0)

Details:

Tomogram 17 (T17) - Tilt series of cryopreserved PC3 cell grown on Quantifoil TEM grids treated with 1x photo IC50 of Pt2 for 1 h followed by 1 irradiation (blue light, λ=465 nm)

Files:

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rsync、aspera、globus 等の利用をおすすめします。

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rsyncコマンド等でファイルリストを指定してダウンロードすることが可能です。

rsync -av --files-from=(path-to-filelist) rsync://empiar.pdbj.org/empiar/archive (path-to-destination)

35. Tomogram 17 (T17) - Tilt series of cryopreserved PC3 cell grown on Quantifoil TEM grids treated with 1x photo IC50 of Pt2 for 1 h followed by 1 irradiation (blue light, λ=465 nm)

Category:

tilt series

Image format:

TIFF

No. of images or tilt series:

Image size:

(946, 946)

Pixel type:

UNSIGNED 16 BIT INTEGER

Pixel spacing:

(158.0, 158.0)

Details:

Tomogram 17 (T17) - Tilt series of cryopreserved PC3 cell grown on Quantifoil TEM grids treated with 1x photo IC50 of Pt2 for 1 h followed by 1 irradiation (blue light, λ=465 nm)

Files:

選択したファイルを無圧縮zipファイルにアーカイブ化してダウンロードします。

rsync、aspera、globus 等の利用をおすすめします。

選択したファイルのリストをダウンロードします。

rsyncコマンド等でファイルリストを指定してダウンロードすることが可能です。

rsync -av --files-from=(path-to-filelist) rsync://empiar.pdbj.org/empiar/archive (path-to-destination)

36. Tomogram 18 (T18) - Tilt series of cryopreserved PC3 cell grown on Quantifoil TEM grids treated with 1x photo IC50 of Pt2 for 1 h followed by 1 irradiation (blue light, λ=465 nm) and 2 h recovery

Category:

tilt series

Image format:

MRC

No. of images or tilt series:

Image size:

(946, 946)

Pixel type:

UNSIGNED 16 BIT INTEGER

Pixel spacing:

(158.0, 158.0)

Details:

Tomogram 18 (T18) - Tilt series of cryopreserved PC3 cell grown on Quantifoil TEM grids treated with 1x photo IC50 of Pt2 for 1 h followed by 1 irradiation (blue light, λ=465 nm) and 2 h recovery in dru free media

Files:

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rsync -av --files-from=(path-to-filelist) rsync://empiar.pdbj.org/empiar/archive (path-to-destination)

37. Tomogram 18 (T18) - Tilt series of cryopreserved PC3 cell grown on Quantifoil TEM grids treated with 1x photo IC50 of Pt2 for 1 h followed by 1 irradiation (blue light, λ=465 nm) and 2 h recovery

Category:

tilt series

Image format:

TIFF

No. of images or tilt series:

Image size:

(946, 946)

Pixel type:

UNSIGNED 16 BIT INTEGER

Pixel spacing:

(158.0, 158.0)

Details:

Files:

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rsync -av --files-from=(path-to-filelist) rsync://empiar.pdbj.org/empiar/archive (path-to-destination)

38. Tomogram 19 (T19) - Tilt series of cryopreserved PC3 cell grown on Quantifoil TEM grids treated with 1x photo IC50 of Pt2 for 1 h followed by 1 irradiation (blue light, λ=465 nm) and 2 h recovery in

Category:

tilt series

Image format:

TIFF

No. of images or tilt series:

Image size:

(946, 946)

Pixel type:

UNSIGNED 16 BIT INTEGER

Pixel spacing:

(158.0, 158.0)

Details:

Tomogram 19 (T19) - Tilt series of cryopreserved PC3 cell grown on Quantifoil TEM grids treated with 1x photo IC50 of Pt2 for 1 h followed by 1 irradiation (blue light, λ=465 nm) and 2 h recovery in drug free media

Files:

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rsync、aspera、globus 等の利用をおすすめします。

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rsyncコマンド等でファイルリストを指定してダウンロードすることが可能です。

rsync -av --files-from=(path-to-filelist) rsync://empiar.pdbj.org/empiar/archive (path-to-destination)

39. Tomogram 19 (T19) - Tilt series of cryopreserved PC3 cell grown on Quantifoil TEM grids treated with 1x photo IC50 of Pt2 for 1 h followed by 1 irradiation (blue light, λ=465 nm) and 2 h recovery in

Category:

tilt series

Image format:

MRC

No. of images or tilt series:

Image size:

(946, 946)

Pixel type:

UNSIGNED 16 BIT INTEGER

Pixel spacing:

(158.0, 158.0)

Details:

Files:

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A variational framework with composite sparse regularization for cryo-electron tomography reconstruction.

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CryoFSL: an annotation-efficient, few-shot learning framework for robust protein particle picking in cryo-electron microscopy micrographs.

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CryoSIP: unleashing protein high-resolution Cryo-EM via semantic-instance collaborative picking.

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prismPYP: Power-spectrum and image domain learning for self-supervised micrograph evaluation.

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Unbend, correction of local beam-induced sample motion in cryo-EM images using a 3D spline model.

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Chart builder: an interactive tool for user driven data visualization in the electron microscopy data bank.

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CryoVirusDB: An Annotated Dataset for AI-Based Virus Particle Identification in Cryo-EM Micrographs.

Gyawali R, Dhakal A, Wang L, Cheng J. (2026)

Dual site targeting of the bacterial 70S ribosome by tetracyclines.

Devarkar SC, Lomakin IB, Wang J, Grada A, Bunick CG. (2026)

Deep-learning methods for contrast enhancement and artifact reduction in cryo-electron tomography: a systematic analysis of the state of the art and proposed improvements.

Jones HN, Deshmukh A, Pande K. (2026)

CryoGS: High-Quality Cryo-EM Homogeneous Reconstruction by Gaussian Splatting

Zeng B, Liu S, Cheng S, Xu G, Fan H. (2026)

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Protein Data Bank Japan News

[2026-06-17]

324件のPDBエントリーが新たに公開されました。（2026-06-17付）