EMPIAR-10986 - Parallel cryo electron tomography (PACE-tomo) of 70S ribosomes (200 kV, side-entry holder) [multiple data sets in MRC format]

EMPIAR-10986

Parallel cryo electron tomography (PACE-tomo) of 70S ribosomes (200 kV, side-entry holder) [multiple data sets in MRC format]

Publication:

Parallel cryo electron tomography on in situ lamellae

Eisenstein F, Yanagisawa H, Kashihara H, Kikkawa M, Tsukita S, Danev R

bioRxiv (2022)

DOI: 10.1101/2022.04.07.487557

Related EMDB entry:

EMD-33116 EMD-33117

Deposited:

2022-03-25

Released:

2022-05-20

Last modified:

2023-01-09

Imageset size:

222.84 GB

Imageset DOI:

10.6019/EMPIAR-10986

Experimental metadata:

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Contains:

micrographs - multiframe
tilt series

Image Sets

1. Movie frames for all tilt series gain corrected with outdated gain reference

Category:

micrographs - multiframe

Image format:

MRC

No. of images or tilt series:

525

Image size:

(3710, 3838)

Pixel type:

UNSIGNED 16 BIT INTEGER

Pixel spacing:

(2.16, 2.16)

Details:

applied gain reference was outdated, additional gain reference was created from all frames using relion_estimate_gain and clamping extreme values

Files:

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2. Tilt series and meta data

Category:

tilt series

Image format:

MRC

No. of images or tilt series:

Image size:

(3710, 3838)

Pixel type:

32 BIT FLOAT

Pixel spacing:

(2.16, 2.16)

Details:

Tilt series sorted by tilt angle, mdoc files and dose files usable in IMOD

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Citations

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Abe KM, Li G, He Q, Grant T, Lim CJ. (2024)

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Fenn KL, Horne JE, Crossley JA, Böhringer N, Horne RJ, Schäberle TF, Calabrese AN, Radford SE, Ranson NA. (2024)

Ubiquitinated histone H2B as gatekeeper of the nucleosome acidic patch.

Hicks CW, Rahman S, Gloor SL, Fields JK, Husby NL, Vaidya A, Maier KE, Morgan M, Keogh MC, Wolberger C. (2024)

Molecular recognition of an odorant by the murine trace amine-associated receptor TAAR7f.

Gusach A, Lee Y, Khoshgrudi AN, Mukhaleva E, Ma N, Koers EJ, Chen Q, Edwards PC, Huang F, Kim J, Mancia F, Veprintsev DB, Vaidehi N, Weyand SN, Tate CG. (2024)

The novel ribosome biogenesis inhibitor usnic acid blocks nucleolar pre-60S maturation.

Kofler L, Grundmann L, Gerhalter M, Prattes M, Merl-Pham J, Zisser G, Grishkovskaya I, Hodirnau VV, Vareka M, Breinbauer R, Hauck SM, Haselbach D, Bergler H. (2024)

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