EMPIAR-10921 - C-terminal half of Leucine Rich Repeat Kinase 1 (LRRK1) [3629 multi-frame micrographs composed of 50 frames each in TIFF format]

EMPIAR-10921

C-terminal half of Leucine Rich Repeat Kinase 1 (LRRK1) [3629 multi-frame micrographs composed of 50 frames each in TIFF format]

Publication:

Structural basis for Parkinson's disease-linked LRRK2's binding to microtubules

Snead DM, Matyszewski M, Dickey AM, Lin YX, Leschziner AE, Reck-Peterson SL

Nature structural & molecular biology 29 (2022) 1196-1207

PMID: 36510024

DOI: 10.1038/s41594-022-00863-y

Related EMDB entry:

EMD-25672

Deposited:

2022-01-08

Released:

2023-01-03

Last modified:

2023-01-03

Imageset size:

1.16 TB

Imageset DOI:

10.6019/EMPIAR-10921

Experimental metadata:

Download xml json

Contains:

micrographs - multiframe

Image Sets

1. Unaligned multi-frame micrographs of the C-terminus of Leucine Rich Repeat Kinase 1 (LRRK1)

Category:

micrographs - multiframe

Image format:

TIFF

No. of images or tilt series:

3629

Image size:

(3710, 3838)

Pixel type:

UNSIGNED 16 BIT INTEGER

Pixel spacing:

(1.16, 1.16)

Details:

Contains 4 datasets: 19dec11a, 19dec21c, 20sep11a, 21jan18d.
All had the total dose set to 55 e/A-2.
20sep11a was collected with a 20-degree tilt.
Each dataset has different number of frames due to changes in beam strength.
19dec11a: 50 frames
19dec21c: 45 frames
20sep11a: 55 frames
21jan18d: 55 frames

Files:

選択したファイルを無圧縮zipファイルにアーカイブ化してダウンロードします。

ダウンロードするファイル数やサイズによっては、膨大な時間がかかります。また、この機能は不安定で正常に動作しない可能性があり、ダウンロードされたファイルのチェックサムは検証されません。

rsync、aspera、globus 等の利用をおすすめします。

選択したファイルのリストをダウンロードします。

rsyncコマンド等でファイルリストを指定してダウンロードすることが可能です。

rsync -av --files-from=(path-to-filelist) rsync://empiar.pdbj.org/empiar/archive (path-to-destination)

Browse All Files

Files:

選択したファイルを無圧縮zipファイルにアーカイブ化してダウンロードします。

rsync、aspera、globus 等の利用をおすすめします。

選択したファイルのリストをダウンロードします。

rsyncコマンド等でファイルリストを指定してダウンロードすることが可能です。

rsync -av --files-from=(path-to-filelist) rsync://empiar.pdbj.org/empiar/archive (path-to-destination)

Quick Links

Talks and Tutorials

EMPIAR Quick tour

Statistics

Publications

Re-use case study

EMPIAR in the news

Claim entries to your ORCiD

COVID-19 Data Portal

EMDB

PDBe

BioImage Archive

EMNavigator@PDBj

PDBj

RCSB@PDBj

EMDataResoruce@RCSB,EMDB,NCMI

Citations

Structural basis for HIV-1 antagonism of host APOBEC3G via Cullin E3 ligase.

Ito F, Alvarez-Cabrera AL, Liu S, Yang H, Shiriaeva A, Zhou ZH, Chen XS. (2023)

The 2023 Nucleic Acids Research Database Issue and the online molecular biology database collection.

Rigden DJ, Fernández XM. (2023)

EMPIAR: the Electron Microscopy Public Image Archive.

Iudin A, Korir PK, Somasundharam S, Weyand S, Cattavitello C, Fonseca N, Salih O, Kleywegt GJ, Patwardhan A. (2023)

CLEMSite, a software for automated phenotypic screens using light microscopy and FIB-SEM.

Serra Lleti JM, Steyer AM, Schieber NL, Neumann B, Tischer C, Hilsenstein V, Holtstrom M, Unrau D, Kirmse R, Lucocq JM, Pepperkok R, Schwab Y. (2023)

Structure of a RecT/Redβ family recombinase in complex with a duplex intermediate of DNA annealing.

Caldwell BJ, Norris AS, Karbowski CF, Wiegand AM, Wysocki VH, Bell CE. (2022)

See all citations

Protein Data Bank Japan News

[2024-04-17]

306件のPDBエントリーが新たに公開されました。（2024-04-17付）

[2024-04-09]

[wwPDB] CASP16 ターゲットを募集しています

[2024-04-02]

PDBj Newsletter Vol.24公開のお知らせ

[2024-03-11]

[wwPDB] 初期モデルの収集を強化しました

[2024-02-15]

サービス提供停止のお知らせ（ASH, DASH, SeSAW, MAFFTash, Spanner, SFAS）

[2024-02-13]

[wwPDB] 10,000件以上のPDB登録を処理したバイオキュレータ

[2024-01-09]

[wwPDB] 拡張PDB IDフォーマット(pdb_00001abc)に関するリソースをご利用ください

[2024-01-04]

[wwPDB] PDBアーカイブとEMDBアーカイブのスナップショットを公開しました

[2023-12-20]

[wwPDB] ORCiDの使用によりユーザ体験が改良されています

[2023-12-14]

[wwPDB] 新規登録の化合物を含むPDBエントリーは、従来のPDBファイルフォーマットでは提供されません

See all news