EMPIAR-10544 - Cryo-EM structure of a dimeric B-Raf:14-3-3 complex reveals asymmetry in the active sites of B-Raf kinases [multiple data sets in MRCS and MRC formats]

EMPIAR-10544

Cryo-EM structure of a dimeric B-Raf:14-3-3 complex reveals asymmetry in the active sites of B-Raf kinases [multiple data sets in MRCS and MRC formats]

Publication:

Cryo-EM structure of a dimeric B-Raf:14-3-3 complex reveals asymmetry in the active sites of B-Raf kinases

Kondo Y, Ognjenović J, Banerjee S, Karandur D, Merk A, Kulhanek K, Wong K, Roose JP, Subramaniam S, Kuriyan J

Science (New York, N.Y.) 366 (2019) 109-115

PMID: 31604311

DOI: 10.1126/science.aay0543

Related EMDB entry:

EMD-20708

Deposited:

2020-10-15

Released:

2022-06-22

Last modified:

2022-06-22

Imageset size:

934.30 GB

Imageset DOI:

10.6019/EMPIAR-10544

Experimental metadata:

Download xml json

Compressed by PDBj:

Image formats and pixel types shown below are those of the original, non-compressed files.

Movies (Dataset?/20*.mrc) in this entry were compressed to TIFF by EMPIAR Japan to save space and bandwidth.
The compression is lossless in that all pixel intensities remain exactly the same after decompression.
However, some metadata in the MRC header were lost.
The original files before compression are available from EMPIAR EBI.

Original size:   3,228,248,644 kilobytes
Compressed size:   979,239,148 kilobytes

Contains:

micrographs - multiframe

Image Sets

1. Unaligned multi-frame micrographs of B-Raf:14-3-3 complex

Category:

micrographs - multiframe

Image format:

MRCS

No. of images or tilt series:

1539

Image size:

(7420, 7676)

Pixel type:

UNSIGNED BYTE

Pixel spacing:

(0.532, 0.532)

Details:

The micrographs are the unaligned, unnormalized super-resolution movie frames (40 frames per micrograph). Total accumulated dose is 50 electrons/Å^2 over a 12 seconds exposure. GainRef.mrc can be used with 270 degrees rotation.

Files:

選択したファイルを無圧縮zipファイルにアーカイブ化してダウンロードします。

ダウンロードするファイル数やサイズによっては、膨大な時間がかかります。また、この機能は不安定で正常に動作しない可能性があり、ダウンロードされたファイルのチェックサムは検証されません。

rsync、aspera、globus 等の利用をおすすめします。

選択したファイルのリストをダウンロードします。

rsyncコマンド等でファイルリストを指定してダウンロードすることが可能です。

rsync -av --files-from=(path-to-filelist) rsync://empiar.pdbj.org/empiar/archive (path-to-destination)

2. Unaligned multi-frame micrographs of B-Raf:14-3-3 complex

Category:

micrographs - multiframe

Image format:

MRC

No. of images or tilt series:

1451

Image size:

(7420, 7676)

Pixel type:

UNSIGNED BYTE

Pixel spacing:

(0.532, 0.532)

Details:

Files:

選択したファイルを無圧縮zipファイルにアーカイブ化してダウンロードします。

rsync、aspera、globus 等の利用をおすすめします。

選択したファイルのリストをダウンロードします。

rsyncコマンド等でファイルリストを指定してダウンロードすることが可能です。

rsync -av --files-from=(path-to-filelist) rsync://empiar.pdbj.org/empiar/archive (path-to-destination)

Browse All Files

Files:

選択したファイルを無圧縮zipファイルにアーカイブ化してダウンロードします。

rsync、aspera、globus 等の利用をおすすめします。

選択したファイルのリストをダウンロードします。

rsyncコマンド等でファイルリストを指定してダウンロードすることが可能です。

rsync -av --files-from=(path-to-filelist) rsync://empiar.pdbj.org/empiar/archive (path-to-destination)

Quick Links

Talks and Tutorials

EMPIAR Quick tour

Statistics

Publications

Re-use case study

EMPIAR in the news

Claim entries to your ORCiD

COVID-19 Data Portal

EMDB

PDBe

BioImage Archive

EMNavigator@PDBj

PDBj

RCSB@PDBj

EMDataResoruce@RCSB,EMDB,NCMI

Citations

Structural basis for HIV-1 antagonism of host APOBEC3G via Cullin E3 ligase.

Ito F, Alvarez-Cabrera AL, Liu S, Yang H, Shiriaeva A, Zhou ZH, Chen XS. (2023)

The 2023 Nucleic Acids Research Database Issue and the online molecular biology database collection.

Rigden DJ, Fernández XM. (2023)

EMPIAR: the Electron Microscopy Public Image Archive.

Iudin A, Korir PK, Somasundharam S, Weyand S, Cattavitello C, Fonseca N, Salih O, Kleywegt GJ, Patwardhan A. (2023)

CLEMSite, a software for automated phenotypic screens using light microscopy and FIB-SEM.

Serra Lleti JM, Steyer AM, Schieber NL, Neumann B, Tischer C, Hilsenstein V, Holtstrom M, Unrau D, Kirmse R, Lucocq JM, Pepperkok R, Schwab Y. (2023)

Structure of a RecT/Redβ family recombinase in complex with a duplex intermediate of DNA annealing.

Caldwell BJ, Norris AS, Karbowski CF, Wiegand AM, Wysocki VH, Bell CE. (2022)

See all citations

Protein Data Bank Japan News

[2024-04-24]

354件のPDBエントリーが新たに公開されました。（2024-04-24付）

[2024-04-09]

[wwPDB] CASP16 ターゲットを募集しています

[2024-04-02]

PDBj Newsletter Vol.24公開のお知らせ

[2024-03-11]

[wwPDB] 初期モデルの収集を強化しました

[2024-02-15]

サービス提供停止のお知らせ（ASH, DASH, SeSAW, MAFFTash, Spanner, SFAS）

[2024-02-13]

[wwPDB] 10,000件以上のPDB登録を処理したバイオキュレータ

[2024-01-09]

[wwPDB] 拡張PDB IDフォーマット(pdb_00001abc)に関するリソースをご利用ください

[2024-01-04]

[wwPDB] PDBアーカイブとEMDBアーカイブのスナップショットを公開しました

[2023-12-20]

[wwPDB] ORCiDの使用によりユーザ体験が改良されています

[2023-12-14]

[wwPDB] 新規登録の化合物を含むPDBエントリーは、従来のPDBファイルフォーマットでは提供されません

See all news