EMPIAR-10532 - Single-Particle CryoEM of Influenza Hemagglutinin (HA) Trimer Vitrified Using Back-it-up [multiple data sets in MRCS and MRC formats]

EMPIAR-10532

Single-Particle CryoEM of Influenza Hemagglutinin (HA) Trimer Vitrified Using Back-it-up [multiple data sets in MRCS and MRC formats]

Publication:

Through-grid wicking enables high-speed cryoEM specimen preparation

Tan YZ, Rubinstein JL

Acta crystallographica. Section D, Structural biology 76 (2020) 1092-1103

PMID: 33135680

DOI: 10.1107/s2059798320012474

Related EMDB entry:

EMD-21954

Deposited:

2020-05-14

Released:

2020-11-11

Last modified:

2025-12-19

Imageset size:

1.22 TB

Imageset DOI:

10.6019/EMPIAR-10532

Experimental metadata:

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Contains:

micrographs - multiframe
micrographs - single frame
picked particles - single frame - processed

Image Sets

1. Unaligned Falcon IV movies

Category:

micrographs - multiframe

Image format:

MRCS

No. of images or tilt series:

1556

Image size:

(4096, 4096)

Pixel type:

SIGNED 16 BIT INTEGER

Pixel spacing:

(1.03, 1.03)

Details:

1,556 movies were acquired from one grid with hemagglutinin prepared with the BIU device. The calibrated pixel size was 1.03 Å. Movies were collected for 9 sec with 29 exposure fractions, a camera exposure rate of ~5 e–/pix/sec, and a total specimen exposure of ~40 e-/Å2. No objective aperture was used. Note: Due to software issues, the last frames in these raw movies have errors. Please exclude the last frame (frame 30) when doing any alignments.

Files:

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2. Aligned micrographs

Category:

micrographs - single frame

Image format:

MRC

No. of images or tilt series:

1556

Image size:

(4096, 4096)

Pixel type:

32 BIT FLOAT

Pixel spacing:

(1.03, 1.03)

Details:

Micrographs were aligned using cryoSPARC patch motion correction.

Files:

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3. Final Refined Particles with Euler Angles and Shifts

Category:

picked particles - single frame - processed

Image format:

MRC

No. of images or tilt series:

128305

Image size:

(256, 256)

Pixel type:

32 BIT FLOAT

Pixel spacing:

(1.03, 1.03)

Details:

Final refined particles from cryoSPARC with Euler angles and shifts.

Files:

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Deng Y, Wang S, Xiang M, Li Y, Zhuo L, Cao D, Fu X, Zou Q. (2026)

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CryoGS: High-Quality Cryo-EM Homogeneous Reconstruction by Gaussian Splatting

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[2026-06-10]

333件のPDBエントリーが新たに公開されました。（2026-06-10付）