EMPIAR-10174 - CryoET of insulin-bound insulin receptor single particle with spot-to-plunge time of 600ms [multiple data sets in MRC format]

EMPIAR-10174

CryoET of insulin-bound insulin receptor single particle with spot-to-plunge time of 600ms [multiple data sets in MRC format]

Publication:

Reducing effects of particle adsorption to the air-water interface in cryoEM

Noble AJ, Wei H, Dandey VP, Zhang Z, Potter CS, Carragher B

BioRxiv (---)

DOI: 10.1101/288340

Related EMDB entry:

EMD-7630

Deposited:

2018-04-03

Released:

2018-04-05

Last modified:

2018-04-05

Imageset size:

79.45 GB

Imageset DOI:

10.6019/EMPIAR-10174

Experimental metadata:

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Contains:

micrographs - multiframe
micrographs - single frame
tilt series

Image Sets

1. K2 tilt-series frames

Category:

micrographs - multiframe

Image format:

MRC

No. of images or tilt series:

Image size:

(3710, 3838)

Pixel type:

UNSIGNED 16 BIT INTEGER

Pixel spacing:

(2.16423, 2.16423)

Details:

~8 e-/px/s dose rate on the camera
Gain and dark references included
Includes tilt-series from the same session (apoferritin at 100ms and 400ms spot-to-plunge time)

Files:

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2. Whole-frame aligned tilt images along with all other magnification images from the collection

Category:

micrographs - single frame

Image format:

MRC

No. of images or tilt series:

Image size:

(3710, 3838)

Pixel type:

32 BIT FLOAT

Pixel spacing:

(2.16423, 2.16423)

Details:

Whole-frame aligned tilt images using Motioncor2.
Includes tilt-series from the same session (apoferritin at 100ms and 400ms spot-to-plunge time)

Files:

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3. Appion-Protomo tilt-series alignments

Category:

tilt series

Image format:

MRC

No. of images or tilt series:

Image size:

(3710, 3838)

Pixel type:

32 BIT FLOAT

Pixel spacing:

(2.16423, 2.16423)

Details:

Includes a full tilt-series alignment run for two of the tilt-series.
To view properly, navigate to the protomo_alignments folder in Appion-Protomo.
The export/ directory contains SerialEM-formatted unaligned tilt-series stacks, mdoc files, and tilt files. This allows for easy upload to Appion-Protomo.

Files:

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CryoVirusDB: An Annotated Dataset for AI-Based Virus Particle Identification in Cryo-EM Micrographs.

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[2026-06-10]

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