EMPIAR-12708 - Single particle cryo-EM micrographs of ROOL RNA nanocage [multiple data sets in MRC format]

EMPIAR-12708

Single particle cryo-EM micrographs of ROOL RNA nanocage [multiple data sets in MRC format]

Publication:

Naturally ornate RNA-only complexes revealed by cryo-EM

Kretsch RC, Wu Y, Shabalina SA, Lee H, Nye G, Koonin EV, Gao A, Chiu W, Das R

bioRxiv (2024)

DOI: 10.1101/2024.12.08.627333

Related EMDB entry:

EMD-48179

Deposited:

2025-04-15

Released:

2025-06-30

Last modified:

2025-06-30

Imageset size:

371.95 GB

Imageset DOI:

10.6019/EMPIAR-12708

Experimental metadata:

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Contains:

micrographs - single frame
picked particles - single frame - processed

Image Sets

1. Aligned and dose-weight averaged micrographs of ROOL RNA nanocage.

Category:

micrographs - single frame

Image format:

MRC

No. of images or tilt series:

4021

Image size:

(5760, 4092)

Pixel type:

32 BIT FLOAT

Pixel spacing:

(0.86, 0.86)

Details:

The micrographs are the dose-weighted average by patch motion correction in cryosparc.

Files:

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2. Particle images of ROOL RNA nanocage.

Category:

picked particles - single frame - processed

Image format:

MRC

No. of images or tilt series:

31656

Image size:

(400, 400)

Pixel type:

32 BIT FLOAT

Pixel spacing:

(1.29, 1.29)

Details:

Particle parameters are from the final D4 reconstruction of ROOL.

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Citations

Small LEA proteins mitigate air-water interface damage to fragile cryo-EM samples during plunge freezing.

Abe KM, Li G, He Q, Grant T, Lim CJ. (2024)

Outer membrane protein assembly mediated by BAM-SurA complexes.

Fenn KL, Horne JE, Crossley JA, Böhringer N, Horne RJ, Schäberle TF, Calabrese AN, Radford SE, Ranson NA. (2024)

Ubiquitinated histone H2B as gatekeeper of the nucleosome acidic patch.

Hicks CW, Rahman S, Gloor SL, Fields JK, Husby NL, Vaidya A, Maier KE, Morgan M, Keogh MC, Wolberger C. (2024)

Molecular recognition of an odorant by the murine trace amine-associated receptor TAAR7f.

Gusach A, Lee Y, Khoshgrudi AN, Mukhaleva E, Ma N, Koers EJ, Chen Q, Edwards PC, Huang F, Kim J, Mancia F, Veprintsev DB, Vaidehi N, Weyand SN, Tate CG. (2024)

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Kofler L, Grundmann L, Gerhalter M, Prattes M, Merl-Pham J, Zisser G, Grishkovskaya I, Hodirnau VV, Vareka M, Breinbauer R, Hauck SM, Haselbach D, Bergler H. (2024)

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