EMPIAR-12444 - Single particle reconstruction of E. coli TnsB in complex with right end fragment of Tn7 transposon [multiple data sets in TIFF and MRCS formats]

EMPIAR-12444

Single particle reconstruction of E. coli TnsB in complex with right end fragment of Tn7 transposon [multiple data sets in TIFF and MRCS formats]

Publication:

Structural basis of transposon end recognition explains central features of Tn7 transposition systems

Kaczmarska Z, Czarnocki-Cieciura M, Górecka-Minakowska KM, Wingo RJ, Jackiewicz J, Zajko W, Poznański JT, Rawski M, Grant T, Peters JE, Nowotny M

Molecular cell 82 (2022) 2618-2632.e7

PMID: 35654042

DOI: 10.1016/j.molcel.2022.05.005

Related EMDB entry:

EMD-13439 EMD-13440

Deposited:

2024-11-02

Released:

2025-02-03

Last modified:

2025-02-03

Imageset size:

4.12 TB

Imageset DOI:

10.6019/EMPIAR-12444

Experimental metadata:

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Contains:

micrographs - multiframe
picked particles - single frame - processed

Image Sets

1. Unaligned multi-frame movies of E. coli TnsB in complex with right end fragment of Tn7 transposon

Category:

micrographs - multiframe

Image format:

TIFF

No. of images or tilt series:

6692

Image size:

(5760, 4092)

Pixel type:

UNSIGNED BYTE

Pixel spacing:

(0.86, 0.86)

Details:

Gain-corrected, unaligned multi-frame movies collected with Krios G3i microscope + K3 detector (superresolution mode, binned 2x with EPU). Voltage: 300 kV; spherical aberration: 2.7; dose per frame: 1 e/A^2 (total dose: 40.16 e/A^2 fractionated over 40 frames). Defocus range (nominal): -2.0, -1.7, -1.4, -1.1, -0.8, -0.5 µm. Objective aperture retracted, C2 aperture: 50 µm.

Files:

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2. Aligned particles of E. coli TnsB in complex with right end fragment of Tn7 transposon (helical reconstruction)

Category:

picked particles - single frame - processed

Image format:

MRCS

No. of images or tilt series:

450748

Image size:

(512, 512)

Pixel type:

32 BIT FLOAT

Pixel spacing:

(0.86, 0.86)

Details:

Aligned particles with corresponding Relion-3 STAR file for helical reconstruction. Coordinates correspond to micrographs binned 2x during Motion correction.

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3. Aligned particles of E. coli TnsB in complex with right end fragment of Tn7 transposon (single particle reconstruction)

Category:

picked particles - single frame - processed

Image format:

MRCS

No. of images or tilt series:

901496

Image size:

(512, 512)

Pixel type:

32 BIT FLOAT

Pixel spacing:

(0.86, 0.86)

Details:

Aligned particles with corresponding Relion-3 STAR file for single particle reconstruction. Particles were signal-subtracted; coordinates correspond to micrographs binned 2x during Motion correction.

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