EMPIAR-11904 - Single particle cryo-EM of ASCT2 in lipid nanodiscs with bound glutamine and Na+ ions [multiple data sets in TIFF format]

EMPIAR-11904

Single particle cryo-EM of ASCT2 in lipid nanodiscs with bound glutamine and Na+ ions [multiple data sets in TIFF format]

Publication:

Structural basis of the obligatory exchange mode of human neutral amino acid transporter ASCT2

Borowska AM, Chiariello MG, Garaeva AA, Rheinberger J, Marrink SJ, Paulino C, Slotboom DJ

(---)

Related EMDB entry:

EMD-18624 EMD-18622 EMD-18623 EMD-18621 EMD-18626 EMD-18625

Deposited:

2024-02-01

Released:

2025-04-24

Last modified:

2025-04-24

Imageset size:

3.36 TB

Imageset DOI:

10.6019/EMPIAR-11904

Experimental metadata:

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Contains:

micrographs - multiframe

Image Sets

1. Unaligned movie frames of ASCT2 in lipid nanodiscs in the presence of glutamine and Na+ ions (dataset 1)

Category:

micrographs - multiframe

Image format:

TIFF

No. of images or tilt series:

1698

Image size:

(5760, 4092)

Pixel type:

UNSIGNED BYTE

Pixel spacing:

(0.836, 0.836)

Details:

Data represents unaligned multi-frame movies. Each movie contains 76 frames collected from the Quantifoil grid at 300 kV in counting mode on a K3 camera. Total accumulated electron exposure on the specimen level corresponds to 60 electrons per Å^2. Movies are not gain-corrected, and the gain reference is provided. Data is LZW-compressed.

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2. Unaligned movie frames of ASCT2 in lipid nanodiscs in the presence of glutamine and Na+ ions (dataset 2)

Category:

micrographs - multiframe

Image format:

TIFF

No. of images or tilt series:

752

Image size:

(5760, 4092)

Pixel type:

UNSIGNED BYTE

Pixel spacing:

(0.836, 0.836)

Details:

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3. Unaligned movie frames of ASCT2 in lipid nanodiscs in the presence of glutamine and Na+ ions (dataset 3)

Category:

micrographs - multiframe

Image format:

TIFF

No. of images or tilt series:

2447

Image size:

(5760, 4092)

Pixel type:

UNSIGNED BYTE

Pixel spacing:

(0.836, 0.836)

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4. Unaligned movie frames of ASCT2 in lipid nanodiscs in the presence of glutamine and Na+ ions (dataset 4)

Category:

micrographs - multiframe

Image format:

TIFF

No. of images or tilt series:

128

Image size:

(5760, 4092)

Pixel type:

UNSIGNED BYTE

Pixel spacing:

(0.836, 0.836)

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5. Unaligned movie frames of ASCT2 in lipid nanodiscs in the presence of glutamine and Na+ ions (dataset 5)

Category:

micrographs - multiframe

Image format:

TIFF

No. of images or tilt series:

1645

Image size:

(5760, 4092)

Pixel type:

UNSIGNED BYTE

Pixel spacing:

(0.836, 0.836)

Details:

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6. Unaligned movie frames of ASCT2 in lipid nanodiscs in the presence of glutamine and Na+ ions (dataset 6)

Category:

micrographs - multiframe

Image format:

TIFF

No. of images or tilt series:

148

Image size:

(5760, 4092)

Pixel type:

UNSIGNED BYTE

Pixel spacing:

(0.836, 0.836)

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7. Unaligned movie frames of ASCT2 in lipid nanodiscs in the presence of glutamine and Na+ ions (dataset 7)

Category:

micrographs - multiframe

Image format:

TIFF

No. of images or tilt series:

1912

Image size:

(5760, 4092)

Pixel type:

UNSIGNED BYTE

Pixel spacing:

(0.836, 0.836)

Details:

Data represents unaligned multi-frame movies. Each movie contains 75 frames collected from the Quantifoil grid at 300 kV in counting mode on a K3 camera. Total accumulated electron exposure on the specimen level corresponds to 60 electrons per Å^2. Movies are not gain-corrected, and the gain reference is provided. Data is LZW-compressed.

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Citations

Small LEA proteins mitigate air-water interface damage to fragile cryo-EM samples during plunge freezing.

Abe KM, Li G, He Q, Grant T, Lim CJ. (2024)

Outer membrane protein assembly mediated by BAM-SurA complexes.

Fenn KL, Horne JE, Crossley JA, Böhringer N, Horne RJ, Schäberle TF, Calabrese AN, Radford SE, Ranson NA. (2024)

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Hicks CW, Rahman S, Gloor SL, Fields JK, Husby NL, Vaidya A, Maier KE, Morgan M, Keogh MC, Wolberger C. (2024)

Molecular recognition of an odorant by the murine trace amine-associated receptor TAAR7f.

Gusach A, Lee Y, Khoshgrudi AN, Mukhaleva E, Ma N, Koers EJ, Chen Q, Edwards PC, Huang F, Kim J, Mancia F, Veprintsev DB, Vaidehi N, Weyand SN, Tate CG. (2024)

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Kofler L, Grundmann L, Gerhalter M, Prattes M, Merl-Pham J, Zisser G, Grishkovskaya I, Hodirnau VV, Vareka M, Breinbauer R, Hauck SM, Haselbach D, Bergler H. (2024)

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