EMPIAR-11752 - Electron cryomicrographs collected as electron events on a direct electron detector for structure determination at 100 keV [multiple data sets in BIG DATA VIEWER HDF5 and MRC formats]

EMPIAR-11752

Electron cryomicrographs collected as electron events on a direct electron detector for structure determination at 100 keV [multiple data sets in BIG DATA VIEWER HDF5 and MRC formats]

Publication:

Structure determination by cryoEM at 100 keV

McMullan G, Naydenova K, Mihaylov D, Yamashita K, Peet MJ, Wilson H, Dickerson JL, Chen S, Cannone G, Lee Y, Hutchings KA, Gittins O, Sobhy MA, Wells T, El-Gomati MM, Dalby J, Meffert M, Schulze-Briese C, Henderson R, Russo CJ

Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 120 (2023)

PMID: 38011573

DOI: 10.1073/pnas.2312905120

Related EMDB entry:

EMD-17959 EMD-17962 EMD-17961 EMD-17967 EMD-17968 EMD-17965 EMD-17963 EMD-17966 EMD-17964 EMD-17958

Deposited:

2023-07-13

Released:

2024-07-08

Last modified:

2024-07-08

Imageset size:

999.31 GB

Imageset DOI:

10.6019/EMPIAR-11752

Experimental metadata:

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Contains:

micrographs - multiframe
micrographs - single frame

Image Sets

1. Electron event files for Structure determination by cryoEM at 100 keV

Category:

micrographs - multiframe

Image format:

BIG DATA VIEWER HDF5

No. of images or tilt series:

4508

Image size:

(1066, 1030)

Pixel type:

UNSIGNED BYTE

Pixel spacing:

(None, None)

Details:

The code to convert .h5 electron event files to MRC is published on ZENODO with DOI: 10.5281/zenodo.10037830

Files:

選択したファイルを無圧縮zipファイルにアーカイブ化してダウンロードします。

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rsync、aspera、globus 等の利用をおすすめします。

選択したファイルのリストをダウンロードします。

rsyncコマンド等でファイルリストを指定してダウンロードすることが可能です。

rsync -av --files-from=(path-to-filelist) rsync://empiar.pdbj.org/empiar/archive (path-to-destination)

2. Non-motion corrected super resolution images from electron events files provided in this deposition

Category:

micrographs - single frame

Image format:

MRC

No. of images or tilt series:

4508

Image size:

(2060, 2132)

Pixel type:

32 BIT FLOAT

Pixel spacing:

(None, None)

Details:

---

Files:

選択したファイルを無圧縮zipファイルにアーカイブ化してダウンロードします。

rsync、aspera、globus 等の利用をおすすめします。

選択したファイルのリストをダウンロードします。

rsyncコマンド等でファイルリストを指定してダウンロードすることが可能です。

rsync -av --files-from=(path-to-filelist) rsync://empiar.pdbj.org/empiar/archive (path-to-destination)

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Citations

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Abe KM, Li G, He Q, Grant T, Lim CJ. (2024)

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Fenn KL, Horne JE, Crossley JA, Böhringer N, Horne RJ, Schäberle TF, Calabrese AN, Radford SE, Ranson NA. (2024)

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Hicks CW, Rahman S, Gloor SL, Fields JK, Husby NL, Vaidya A, Maier KE, Morgan M, Keogh MC, Wolberger C. (2024)

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Gusach A, Lee Y, Khoshgrudi AN, Mukhaleva E, Ma N, Koers EJ, Chen Q, Edwards PC, Huang F, Kim J, Mancia F, Veprintsev DB, Vaidehi N, Weyand SN, Tate CG. (2024)

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Kofler L, Grundmann L, Gerhalter M, Prattes M, Merl-Pham J, Zisser G, Grishkovskaya I, Hodirnau VV, Vareka M, Breinbauer R, Hauck SM, Haselbach D, Bergler H. (2024)

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