EMPIAR-11601 - Porcine uroplakin complex [multiple data sets in TIFF format]

EMPIAR-11601

Porcine uroplakin complex [multiple data sets in TIFF format]

Publication:

Unveiling Liquid-Crystalline Lipids in the Urothelial Membrane through Cryo-EM

Yanagisawa H, Kita Y, Oda T, Kikkawa M

(---)

Related EMDB entry:

EMD-36340

Deposited:

2023-05-22

Released:

2023-09-14

Last modified:

2023-09-14

Imageset size:

1.43 TB

Imageset DOI:

10.6019/EMPIAR-11601

Experimental metadata:

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Deposited via PDBj

Contains:

micrographs - multiframe

Image Sets

1. Sep20-2022

Category:

micrographs - multiframe

Image format:

TIFF

No. of images or tilt series:

2059

Image size:

(5760, 4092)

Pixel type:

UNSIGNED BYTE

Pixel spacing:

(1.35, 1.35)

Details:

Please use CountRef_uplk_146-1_0.0_Sep19_15.13.58_X-1Y-1-0.mrc as a gain reference without rotation or flipping.
The images were recorded with 3x3 image shifts but the beam tilt was not refined per direction.
The "XnnYmm" part of the file name represents the image shift direction.

Cs 2.7 mm
300 kV
1.0 e/A2/frame

Files:

選択したファイルを無圧縮zipファイルにアーカイブ化してダウンロードします。

ダウンロードするファイル数やサイズによっては、膨大な時間がかかります。また、この機能は不安定で正常に動作しない可能性があり、ダウンロードされたファイルのチェックサムは検証されません。

rsync、aspera、globus 等の利用をおすすめします。

選択したファイルのリストをダウンロードします。

rsyncコマンド等でファイルリストを指定してダウンロードすることが可能です。

rsync -av --files-from=(path-to-filelist) rsync://empiar.pdbj.org/empiar/archive (path-to-destination)

2. Oct10-2022

Category:

micrographs - multiframe

Image format:

TIFF

No. of images or tilt series:

2252

Image size:

(5760, 4092)

Pixel type:

UNSIGNED BYTE

Pixel spacing:

(1.35, 1.35)

Details:

Please use CountRef_uplk_30-1_-0.0_Oct10_14.32.17_X-1Y-1-0.mrc as a gain reference without rotation or flipping.
The images were recorded with 3x3 image shifts but the beam tilt was not refined per direction.
The "XnnYmm" part of the file name represents the image shift direction.

Cs 2.7 mm
300 kV
1.0 e/A2/frame

Files:

選択したファイルを無圧縮zipファイルにアーカイブ化してダウンロードします。

rsync、aspera、globus 等の利用をおすすめします。

選択したファイルのリストをダウンロードします。

rsyncコマンド等でファイルリストを指定してダウンロードすることが可能です。

rsync -av --files-from=(path-to-filelist) rsync://empiar.pdbj.org/empiar/archive (path-to-destination)

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Citations

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Abe KM, Li G, He Q, Grant T, Lim CJ. (2024)

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Fenn KL, Horne JE, Crossley JA, Böhringer N, Horne RJ, Schäberle TF, Calabrese AN, Radford SE, Ranson NA. (2024)

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Hicks CW, Rahman S, Gloor SL, Fields JK, Husby NL, Vaidya A, Maier KE, Morgan M, Keogh MC, Wolberger C. (2024)

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Gusach A, Lee Y, Khoshgrudi AN, Mukhaleva E, Ma N, Koers EJ, Chen Q, Edwards PC, Huang F, Kim J, Mancia F, Veprintsev DB, Vaidehi N, Weyand SN, Tate CG. (2024)

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