EMPIAR-11354 - Single particle cryo-EM dataset for E. coli MlaFEDB bound to MlaC [multiple data sets in MRC and TIFF formats]

EMPIAR-11354

Single particle cryo-EM dataset for E. coli MlaFEDB bound to MlaC [multiple data sets in MRC and TIFF formats]

Publication:

Protein-protein interactions in the Mla lipid transport system probed by computational structure prediction and deep mutational scanning

MacRae MR, Puvanendran D, Haase MAB, Coudray N, Kolich L, Lam C, Baek M, Bhabha G, Ekiert DC

The Journal of biological chemistry (2023)

PMID: 37100290

DOI: 10.1016/j.jbc.2023.104744

Related EMDB entry:

EMD-40162

Deposited:

2022-11-03

Released:

2023-01-30

Last modified:

2023-05-10

Imageset size:

5.02 TB

Imageset DOI:

10.6019/EMPIAR-11354

Experimental metadata:

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Contains:

micrographs - single frame
micrographs - multiframe

Image Sets

1. Aligned frames of MlaFEDB & MlaC complex (tilted dataset)

Category:

micrographs - single frame

Image format:

MRC

No. of images or tilt series:

3874

Image size:

(5760, 4092)

Pixel type:

32 BIT FLOAT

Pixel spacing:

(1.096, 1.096)

Details:

Aligned micrographs (tilted dataset)

Files:

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2. unaligned frames of MlaFEDB & MlaC complex (tilted dataset)

Category:

micrographs - multiframe

Image format:

TIFF

No. of images or tilt series:

3874

Image size:

(11520, 8184)

Pixel type:

UNSIGNED BYTE

Pixel spacing:

(0.548, 0.548)

Details:

Unaligned frames (tilted dataset)

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3. Aligned frames of MlaFEDB & MlaC complex (untilted dataset)

Category:

micrographs - single frame

Image format:

MRC

No. of images or tilt series:

3449

Image size:

(5760, 4092)

Pixel type:

32 BIT FLOAT

Pixel spacing:

(1.096, 1.096)

Details:

Aligned micrographs (untilted dataset)

Files:

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4. Unaligned frames of MlaFEDB & MlaC complex (untilted dataset)

Category:

micrographs - multiframe

Image format:

TIFF

No. of images or tilt series:

3449

Image size:

(11520, 8184)

Pixel type:

UNSIGNED BYTE

Pixel spacing:

(0.548, 0.548)

Details:

Unaligned frames (untilted dataset)

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Citations

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Abe KM, Li G, He Q, Grant T, Lim CJ. (2024)

Outer membrane protein assembly mediated by BAM-SurA complexes.

Fenn KL, Horne JE, Crossley JA, Böhringer N, Horne RJ, Schäberle TF, Calabrese AN, Radford SE, Ranson NA. (2024)

Ubiquitinated histone H2B as gatekeeper of the nucleosome acidic patch.

Hicks CW, Rahman S, Gloor SL, Fields JK, Husby NL, Vaidya A, Maier KE, Morgan M, Keogh MC, Wolberger C. (2024)

Molecular recognition of an odorant by the murine trace amine-associated receptor TAAR7f.

Gusach A, Lee Y, Khoshgrudi AN, Mukhaleva E, Ma N, Koers EJ, Chen Q, Edwards PC, Huang F, Kim J, Mancia F, Veprintsev DB, Vaidehi N, Weyand SN, Tate CG. (2024)

The novel ribosome biogenesis inhibitor usnic acid blocks nucleolar pre-60S maturation.

Kofler L, Grundmann L, Gerhalter M, Prattes M, Merl-Pham J, Zisser G, Grishkovskaya I, Hodirnau VV, Vareka M, Breinbauer R, Hauck SM, Haselbach D, Bergler H. (2024)

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