EMPIAR-11309 - Cryo-EM structure of the wild-type solitary ECF module in MSP2N2 lipid nanodiscs in the ATPase open and nucleotide-free conformation (200 kV) [multiple data sets in TIFF format]

EMPIAR-11309

Cryo-EM structure of the wild-type solitary ECF module in MSP2N2 lipid nanodiscs in the ATPase open and nucleotide-free conformation (200 kV) [multiple data sets in TIFF format]

Publication:

Expulsion mechanism of the substrate-translocating subunit in ECF transporters

Thangaratnarajah C, Nijland M, Borges-Araújo L, Jeucken A, Rheinberger J, Marrink SJ, Souza PCT, Paulino C, Slotboom DJ

Nature communications 14 (2023)

PMID: 37491368

DOI: 10.1038/s41467-023-40266-1

Related EMDB entry:

EMD-16122

Deposited:

2022-11-15

Released:

2023-08-18

Last modified:

2023-08-18

Imageset size:

1.89 TB

Imageset DOI:

10.6019/EMPIAR-11309

Experimental metadata:

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Contains:

micrographs - multiframe

Image Sets

1. Unaligned movie frames (Dataset 1)

Category:

micrographs - multiframe

Image format:

TIFF

No. of images or tilt series:

1400

Image size:

(3838, 3710)

Pixel type:

UNSIGNED BYTE

Pixel spacing:

(1.022, 1.022)

Details:

Unaligned multi-frame movies with each containing 60 frames per movie collected from a Quantifoil Au 1.2/1.3 300 mesh grid at 200 kV in counting mode. Total accumulated electron exposure on the specimen level corresponds to 50.1 electrons per Å^2. Movies are not gain corrected and the gain reference is provided. Data acquired with SerialEM using a 3 x 3 multi-shot array.

Files:

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2. Unaligned movie frames (Dataset 2)

Category:

micrographs - multiframe

Image format:

TIFF

No. of images or tilt series:

4205

Image size:

(3838, 3710)

Pixel type:

UNSIGNED BYTE

Pixel spacing:

(1.022, 1.022)

Details:

Files:

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3. Unaligned movie frames (Dataset 3)

Category:

micrographs - multiframe

Image format:

TIFF

No. of images or tilt series:

Image size:

(3838, 3710)

Pixel type:

UNSIGNED BYTE

Pixel spacing:

(1.022, 1.022)

Details:

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4. Unaligned movie frames (Dataset 4)

Category:

micrographs - multiframe

Image format:

TIFF

No. of images or tilt series:

2981

Image size:

(3838, 3710)

Pixel type:

UNSIGNED BYTE

Pixel spacing:

(1.022, 1.022)

Details:

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Citations

Small LEA proteins mitigate air-water interface damage to fragile cryo-EM samples during plunge freezing.

Abe KM, Li G, He Q, Grant T, Lim CJ. (2024)

Outer membrane protein assembly mediated by BAM-SurA complexes.

Fenn KL, Horne JE, Crossley JA, Böhringer N, Horne RJ, Schäberle TF, Calabrese AN, Radford SE, Ranson NA. (2024)

Ubiquitinated histone H2B as gatekeeper of the nucleosome acidic patch.

Hicks CW, Rahman S, Gloor SL, Fields JK, Husby NL, Vaidya A, Maier KE, Morgan M, Keogh MC, Wolberger C. (2024)

Molecular recognition of an odorant by the murine trace amine-associated receptor TAAR7f.

Gusach A, Lee Y, Khoshgrudi AN, Mukhaleva E, Ma N, Koers EJ, Chen Q, Edwards PC, Huang F, Kim J, Mancia F, Veprintsev DB, Vaidehi N, Weyand SN, Tate CG. (2024)

The novel ribosome biogenesis inhibitor usnic acid blocks nucleolar pre-60S maturation.

Kofler L, Grundmann L, Gerhalter M, Prattes M, Merl-Pham J, Zisser G, Grishkovskaya I, Hodirnau VV, Vareka M, Breinbauer R, Hauck SM, Haselbach D, Bergler H. (2024)

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