EMPIAR-11244 - Escherichia coli gyrase holocomplex with 217 bp phage Mu SGS DNA and albicidin stabilised by ADPNP [14469 multi-frame micrographs composed of 40 frames each in TIFF format]

EMPIAR-11244

Escherichia coli gyrase holocomplex with 217 bp phage Mu SGS DNA and albicidin stabilised by ADPNP [14469 multi-frame micrographs composed of 40 frames each in TIFF format]

Publication:

Molecular mechanism of topoisomerase poisoning by the peptide antibiotic albicidin

Michalczyk E, Hommernick K, Behroz I, Kulike M, Pakosz-Stępień Z, Mazurek L, Seidel M, Kunert M, Santos K, von Moeller H, Loll B, Weston JB, Mainz A, Heddle JG, Süssmuth RD, Ghilarov D

Nature catalysis 6 (2023) 52-67

PMID: 36741192

DOI: 10.1038/s41929-022-00904-1

Related EMDB entry:

EMD-14570

Deposited:

2022-09-05

Released:

2023-02-15

Last modified:

2023-02-15

Imageset size:

5.12 TB

Imageset DOI:

10.6019/EMPIAR-11244

Experimental metadata:

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Contains:

micrographs - multiframe

Image Sets

1. Un-aligned, gain-corrected multi frame movies of E. coli Gyrase Mu 217 Albicidin complex

Category:

micrographs - multiframe

Image format:

TIFF

No. of images or tilt series:

14469

Image size:

(5760, 4092)

Pixel type:

UNSIGNED BYTE

Pixel spacing:

(0.86, 0.86)

Details:

40 raw movie frames accumulating a total dose of 40 electron per square angstrom. Gain-normalised K3 TIFFs

Files:

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Gusach A, Lee Y, Khoshgrudi AN, Mukhaleva E, Ma N, Koers EJ, Chen Q, Edwards PC, Huang F, Kim J, Mancia F, Veprintsev DB, Vaidehi N, Weyand SN, Tate CG. (2024)

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