EMPIAR-10548 - Cryo-ET of actin bundles induced by full length vinculin [2 tilt series in MRC format]

EMPIAR-10548

Cryo-ET of actin bundles induced by full length vinculin [2 tilt series in MRC format]

Publication:

Talin-activated vinculin interacts with branched actin networks to initiate bundles

Rajaa Boujemaa-Paterski RBP, Bruno Martins BM, Matthias Eibauer ME, Charlie Beales CB, Benjamin Geiger BG, Medalia O

eLife 9 (2020)

PMID: 33185186

DOI: 10.7554/elife.53990

Related EMDB entry:

EMD-10737

Deposited:

2020-11-09

Released:

2020-11-20

Last modified:

2020-11-20

Imageset size:

4.00 GB

Imageset DOI:

10.6019/EMPIAR-10548

Experimental metadata:

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Contains:

tilt series

Image Sets

1. Tomograms of actin bundles induced by full length vinculin

Category:

tilt series

Image format:

MRC

No. of images or tilt series:

Image size:

(1024, 1024)

Pixel type:

32 BIT FLOAT

Pixel spacing:

(1.7, 1.7)

Details:

The tilt-series were acquired at a dose-fractionated frame rate of 1 frame per 0.2 seconds, at a magnification of 42,000 x with 0.17 nm pixel size, and recorded with a 2° increment over a -60° to 60° angular range (accumulating ~70 electrons per squared Angstrom) at a -4 defocus. The tilt-series were then down-sampled, motion-corrected, contrast transfer function corrected and reconstructed in volumes with a size of 1024x1024x512 voxel (with 8x8 total down-sampling and a voxel size of 13.6 Angstrom).

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Gusach A, Lee Y, Khoshgrudi AN, Mukhaleva E, Ma N, Koers EJ, Chen Q, Edwards PC, Huang F, Kim J, Mancia F, Veprintsev DB, Vaidehi N, Weyand SN, Tate CG. (2024)

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