EMPIAR-10160 - Conformational Dynamics of human Bact spliceosome [multiple data sets in MRC format]

EMPIAR-10160

Conformational Dynamics of human Bact spliceosome [multiple data sets in MRC format]

Publication:

Structure and Conformational Dynamics of the Human Spliceosomal Bact Complex

Haselbach D, Komarov I, Agafonov DE, Hartmuth K, Graf B, Dybkov O, Urlaub H, Kastner B, Lührmann R, Stark H

Cell 172 (2018) 454-464.e11

PMID: 29361316

DOI: 10.1016/j.cell.2018.01.010

Related EMDB entry:

EMD-4237 EMD-4236 EMD-4235 EMD-4233 EMD-4239 EMD-4238 EMD-4234 EMD-4240

Deposited:

2018-01-03

Released:

2018-04-03

Last modified:

2018-04-03

Imageset size:

2.78 TB

Imageset DOI:

10.6019/EMPIAR-10160

Experimental metadata:

Download xml json

Contains:

micrographs - single frame

Image Sets

1. aligned and summed micrograph stack of human Bact spliceosome

Category:

micrographs - single frame

Image format:

MRC

No. of images or tilt series:

22814

Image size:

(4096, 4096)

Pixel type:

32 BIT FLOAT

Pixel spacing:

(1.16, 1.16)

Details:

summed and aligned but not dose weighted frames, recorded with 40 electrons per squared angstroem

Files:

選択したファイルを無圧縮zipファイルにアーカイブ化してダウンロードします。

ダウンロードするファイル数やサイズによっては、膨大な時間がかかります。また、この機能は不安定で正常に動作しない可能性があり、ダウンロードされたファイルのチェックサムは検証されません。

rsync、aspera、globus 等の利用をおすすめします。

選択したファイルのリストをダウンロードします。

rsyncコマンド等でファイルリストを指定してダウンロードすることが可能です。

rsync -av --files-from=(path-to-filelist) rsync://empiar.pdbj.org/empiar/archive (path-to-destination)

2. aligned, dose-weighted and summed micrograph stack of human Bact spliceosome

Category:

micrographs - single frame

Image format:

MRC

No. of images or tilt series:

22814

Image size:

(4096, 4096)

Pixel type:

32 BIT FLOAT

Pixel spacing:

(1.16, 1.16)

Details:

summed, aligned and dose weighted frames, recorded with 40 electrons per squared angstroem

Files:

選択したファイルを無圧縮zipファイルにアーカイブ化してダウンロードします。

rsync、aspera、globus 等の利用をおすすめします。

選択したファイルのリストをダウンロードします。

rsyncコマンド等でファイルリストを指定してダウンロードすることが可能です。

rsync -av --files-from=(path-to-filelist) rsync://empiar.pdbj.org/empiar/archive (path-to-destination)

Browse All Files

Quick Links

Talks and Tutorials

EMPIAR Quick tour

Statistics

Publications

Re-use case study

EMPIAR in the news

Claim entries to your ORCiD

COVID-19 Data Portal

EMDB

PDBe

BioImage Archive

EMNavigator@PDBj

PDBj

RCSB@PDBj

EMDataResoruce@RCSB,EMDB,NCMI

Citations

Small LEA proteins mitigate air-water interface damage to fragile cryo-EM samples during plunge freezing.

Abe KM, Li G, He Q, Grant T, Lim CJ. (2024)

Outer membrane protein assembly mediated by BAM-SurA complexes.

Fenn KL, Horne JE, Crossley JA, Böhringer N, Horne RJ, Schäberle TF, Calabrese AN, Radford SE, Ranson NA. (2024)

Ubiquitinated histone H2B as gatekeeper of the nucleosome acidic patch.

Hicks CW, Rahman S, Gloor SL, Fields JK, Husby NL, Vaidya A, Maier KE, Morgan M, Keogh MC, Wolberger C. (2024)

Molecular recognition of an odorant by the murine trace amine-associated receptor TAAR7f.

Gusach A, Lee Y, Khoshgrudi AN, Mukhaleva E, Ma N, Koers EJ, Chen Q, Edwards PC, Huang F, Kim J, Mancia F, Veprintsev DB, Vaidehi N, Weyand SN, Tate CG. (2024)

The novel ribosome biogenesis inhibitor usnic acid blocks nucleolar pre-60S maturation.

Kofler L, Grundmann L, Gerhalter M, Prattes M, Merl-Pham J, Zisser G, Grishkovskaya I, Hodirnau VV, Vareka M, Breinbauer R, Hauck SM, Haselbach D, Bergler H. (2024)

See all citations

Protein Data Bank Japan News

[2025-01-30]

[wwPDB] PDBx/mmCIF ユーザーガイドのアンケートに答えると抽選で賞品が当たります！

[2025-01-29]

303件のPDBエントリーが新たに公開されました。（2025-01-29付）

[2025-01-17]

[wwPDB] PDB-DevはPDB-IHMへ改名しました

[2025-01-09]

[wwPDB] PDBアーカイブとEMDBアーカイブのスナップショットを公開しました

[2024-11-28]

[wwPDB] PDBアーカイブからSDF/MOL形式のCCDファイルをご利用頂けます