Electron Microscopy Public Image Archive

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EMPIAR (Electron Microscopy Public Image Archive)は、2Dの電子顕微鏡画像の生データを集めた公共データベースです。 3D構造を再構築するために用いた、大量の生の2D 画像を、ブラウズしたり、ダウンロードして再計算してみることができます。

EMPIARの目的は、最先端の技術による生データに容易にアクセスできるようにすることで、手法開発や検証作業を促進し、 よりよい3D構造が得られるように導くことです。 3D画像が収納されたElectrion Microscopy Data Bank (EMDB)を, EMPIARは補完する役割を持ちます。 EMPIARは、電子顕微鏡の研究者のコミュニティからの意見に基づいています。 特に、 the Protein Data Bank in Europe (PDBe) と the Open Microscopy Environment (OME)によって企画された二つのワークショップ、 "Data Management Challenges in Three-dimensional EM" (Patwardhan et al., Nat. Struct. Mol. Biol. 19, 1203-1207 (2012)) と "A 3D Cellular Context for the Macromolecular World" (Patwardhan et al., Nat. Struct. Mol. Biol. 21, 841-845 (2014))でEMPIARについての意見交換が行われました。